59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1792 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  99.66 
 
 		 290 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 		 290 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0547124 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  100 
 
 		 290 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2115  copper resistance protein D  99.66 
 
 		 290 aa  570  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  98.97 
 
 		 290 aa  566  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1347  copper resistance protein D  98.62 
 
 		 290 aa  565  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.579669  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  98.97 
 
 		 290 aa  566  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  98.28 
 
 		 290 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  98.28 
 
 		 290 aa  561  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  65.17 
 
 		 291 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  65.17 
 
 		 291 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  65.17 
 
 		 291 aa  381  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  64.83 
 
 		 291 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  65.17 
 
 		 291 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.792171 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  55.17 
 
 		 290 aa  323  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2338  copper resistance protein D  40.55 
 
 		 294 aa  183  3e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.30506  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1622  copper resistance protein D  40.21 
 
 		 294 aa  180  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.283422  normal  0.570002 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2436  copper resistance D domain-containing protein  40.21 
 
 		 294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1944  copper resistance D domain-containing protein  39.18 
 
 		 293 aa  169  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2237  copper resistance D domain protein  37.59 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2125  copper resistance D domain protein  38.46 
 
 		 292 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4216  Cu resistance protein  34.85 
 
 		 292 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  28.62 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  30.57 
 
 		 309 aa  86.7  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  29.35 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  30.71 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  28.05 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1496  copper resistance D  29.47 
 
 		 310 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  28.97 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  26.4 
 
 		 309 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6115  copper resistance protein CopD  27.24 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0426726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  26.4 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3413  copper resistance D domain-containing protein  26.47 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  26.4 
 
 		 309 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3447  copper resistance D  30.31 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2924  copper resistance D  30.39 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1837  copper resistance D domain protein  26.16 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.124234  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  27.51 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2426  copper resistance D  27.17 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  28.57 
 
 		 308 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  25.68 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2486  copper resistance D  27.16 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.877356  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6631  copper resistance D domain protein  34.34 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2222  copper resistance D domain protein  34.29 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0467  copper resistance D domain protein  29.49 
 
 		 313 aa  54.7  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  27.43 
 
 		 718 aa  53.1  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2346  copper resistance D domain-containing protein  25.82 
 
 		 305 aa  50.4  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3813  copper resistance D  30.77 
 
 		 287 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  28.29 
 
 		 687 aa  47.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  32 
 
 		 663 aa  47.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  34.26 
 
 		 288 aa  46.6  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  23.89 
 
 		 697 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0659  copper resistance D transmembrane protein  27.04 
 
 		 309 aa  46.6  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00389  putative copper export protein  25.1 
 
 		 295 aa  45.8  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  28.28 
 
 		 549 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  25.6 
 
 		 718 aa  43.9  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00324  putative copper export protein  24.29 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.170745  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  28.67 
 
 		 708 aa  43.5  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  50.88 
 
 		 513 aa  43.5  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>