97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1722 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  100 
 
 		 309 aa  600  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  100 
 
 		 309 aa  600  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  95.79 
 
 		 309 aa  578  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  73.79 
 
 		 309 aa  442  1e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1837  copper resistance D domain protein  73.14 
 
 		 309 aa  425  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.124234  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  57.93 
 
 		 308 aa  328  5.0000000000000004e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0659  copper resistance D transmembrane protein  68.51 
 
 		 309 aa  325  9e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6115  copper resistance protein CopD  55.78 
 
 		 305 aa  294  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0426726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  49.35 
 
 		 299 aa  251  9.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1496  copper resistance D  43.75 
 
 		 310 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2486  copper resistance D  48.05 
 
 		 303 aa  215  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.877356  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3413  copper resistance D domain-containing protein  38.96 
 
 		 309 aa  198  9e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2341  copper resistance D domain-containing protein  43.17 
 
 		 317 aa  176  5e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  40.58 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3813  copper resistance D  42.52 
 
 		 287 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2346  copper resistance D domain-containing protein  37.12 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2426  copper resistance D  38.06 
 
 		 322 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2164  copper resistance D domain protein  37.67 
 
 		 294 aa  119  7.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600658 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  36.18 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2924  copper resistance D  36.86 
 
 		 284 aa  114  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  38.17 
 
 		 319 aa  113  5e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  31.39 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  32.13 
 
 		 309 aa  94  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  35.23 
 
 		 310 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  31.3 
 
 		 290 aa  86.7  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1622  copper resistance protein D  28.78 
 
 		 294 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.283422  normal  0.570002 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2338  copper resistance protein D  28.78 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.30506  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2436  copper resistance D domain-containing protein  28.78 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  27.36 
 
 		 291 aa  72.4  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  27.36 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  27.36 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  26.45 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  27.04 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1944  copper resistance D domain-containing protein  38.64 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  33.33 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.792171 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  26.4 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0547124 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  26.4 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  26.07 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  26.13 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2237  copper resistance D domain protein  35.91 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  26.13 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4216  Cu resistance protein  29.69 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  27.2 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2115  copper resistance protein D  26.07 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1347  copper resistance protein D  25.48 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.579669  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  32.12 
 
 		 559 aa  59.7  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  35.88 
 
 		 560 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00580  putative copper export protein  33.14 
 
 		 343 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1972  copper resistance D domain-containing protein  33.33 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.910407  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2125  copper resistance D domain protein  24.82 
 
 		 292 aa  57.4  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  32.76 
 
 		 551 aa  56.2  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  37.8 
 
 		 288 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  29.55 
 
 		 663 aa  53.9  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  24.08 
 
 		 547 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0717  putative copper resistance protein D  32.3 
 
 		 314 aa  52.8  0.000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190026  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  34.62 
 
 		 564 aa  52.4  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3447  copper resistance D  34.32 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  32.97 
 
 		 565 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  30.35 
 
 		 613 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6631  copper resistance D domain protein  27.36 
 
 		 283 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  35.92 
 
 		 869 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  28.15 
 
 		 571 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  22.95 
 
 		 544 aa  50.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2012  putative copper-resistance membrane protein  32.92 
 
 		 314 aa  50.4  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4290  copper resistance D domain-containing protein  32.43 
 
 		 298 aa  50.4  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180937  normal  0.688919 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  34.78 
 
 		 544 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  37.96 
 
 		 513 aa  50.4  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0252  copper resistance D domain-containing protein  32.43 
 
 		 298 aa  50.4  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.956933  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  32.2 
 
 		 439 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  34.78 
 
 		 544 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6288  copper resistance D domain-containing protein  30 
 
 		 313 aa  50.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.228159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2060  copper resistance D domain protein  35.34 
 
 		 400 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  30.66 
 
 		 343 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  30.48 
 
 		 364 aa  48.5  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  31.36 
 
 		 544 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  25.09 
 
 		 549 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1742  copper resistance D  27.31 
 
 		 288 aa  47.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0121133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  31.35 
 
 		 590 aa  47  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  25 
 
 		 547 aa  47  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  31.98 
 
 		 578 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2596  copper resistance protein  35.88 
 
 		 512 aa  47  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449295  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5193  copper resistance D domain-containing protein  32.35 
 
 		 313 aa  46.6  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  31.36 
 
 		 547 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2222  copper resistance D domain protein  34.23 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3532  copper resistance D domain protein  33.08 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1956  copper resistance protein, putative  31.56 
 
 		 315 aa  44.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4608  copper resistance D domain protein  33.08 
 
 		 314 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  34.38 
 
 		 588 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  32.58 
 
 		 549 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00389  putative copper export protein  22.89 
 
 		 295 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3356  copper resistance D domain-containing protein  32.02 
 
 		 306 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  35.38 
 
 		 607 aa  43.1  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  27.23 
 
 		 687 aa  43.5  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0467  copper resistance D domain protein  35.42 
 
 		 313 aa  43.1  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  25.67 
 
 		 702 aa  42.4  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  25.67 
 
 		 702 aa  42.4  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00324  putative copper export protein  23.31 
 
 		 304 aa  42.4  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.170745  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>