61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2069 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  100 
 
 
290 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  98.62 
 
 
290 aa  566  1e-160  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2115  copper resistance protein D  98.62 
 
 
290 aa  565  1e-160  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  98.97 
 
 
290 aa  566  1e-160  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0547124 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  98.97 
 
 
290 aa  566  1e-160  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  98.28 
 
 
290 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1347  copper resistance protein D  97.93 
 
 
290 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.579669  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  97.24 
 
 
290 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  97.24 
 
 
290 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  64.48 
 
 
291 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  64.48 
 
 
291 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  64.48 
 
 
291 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  64.14 
 
 
291 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  64.48 
 
 
291 aa  363  2e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.792171 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  55.17 
 
 
290 aa  322  4e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2338  copper resistance protein D  40.55 
 
 
294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.30506  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2436  copper resistance D domain-containing protein  40.21 
 
 
294 aa  179  4e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1622  copper resistance protein D  40.21 
 
 
294 aa  179  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.283422  normal  0.570002 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1944  copper resistance D domain-containing protein  39.52 
 
 
293 aa  169  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2237  copper resistance D domain protein  37.59 
 
 
291 aa  156  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2125  copper resistance D domain protein  38.46 
 
 
292 aa  136  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4216  Cu resistance protein  34.85 
 
 
292 aa  128  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  28.62 
 
 
316 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  31.14 
 
 
309 aa  87.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  29.03 
 
 
319 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  31.07 
 
 
310 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  29.17 
 
 
309 aa  80.1  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1496  copper resistance D  29.47 
 
 
310 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  28.97 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  26.45 
 
 
309 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  26.45 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  26.45 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6115  copper resistance protein CopD  27.24 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0426726  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3413  copper resistance D domain-containing protein  26.47 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2924  copper resistance D  30.73 
 
 
284 aa  69.3  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3447  copper resistance D  30.31 
 
 
285 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  26.82 
 
 
310 aa  67.8  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1837  copper resistance D domain protein  27.27 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.124234  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2426  copper resistance D  27.17 
 
 
322 aa  65.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  26.03 
 
 
299 aa  65.1  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  28.57 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2486  copper resistance D  27.24 
 
 
303 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.877356  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2222  copper resistance D domain protein  34.29 
 
 
302 aa  56.6  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0467  copper resistance D domain protein  29.81 
 
 
313 aa  55.8  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6631  copper resistance D domain protein  34.34 
 
 
283 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  28 
 
 
718 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2346  copper resistance D domain-containing protein  26.14 
 
 
305 aa  53.1  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3813  copper resistance D  30.77 
 
 
287 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  24.86 
 
 
697 aa  47  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  32 
 
 
663 aa  47.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  34.26 
 
 
288 aa  46.6  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00324  putative copper export protein  24.39 
 
 
304 aa  46.6  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.170745  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0659  copper resistance D transmembrane protein  27.51 
 
 
309 aa  46.2  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00389  putative copper export protein  24.14 
 
 
295 aa  46.2  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  27.89 
 
 
687 aa  45.8  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  27.69 
 
 
549 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  26.4 
 
 
718 aa  44.7  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  50.88 
 
 
513 aa  43.5  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2592  copper resistance D domain-containing protein  31.55 
 
 
310 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  26.73 
 
 
544 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2720  copper resistance D domain-containing protein  31.55 
 
 
310 aa  42.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>