55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2592 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2592  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 		 310 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2720  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 		 310 aa  580  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5995  copper resistance D  93.23 
 
 		 310 aa  461  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2696  copper resistance D domain-containing protein  91.94 
 
 		 310 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2667  copper resistance D domain-containing protein  91.61 
 
 		 310 aa  454  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2056  copper resistance D  91.61 
 
 		 310 aa  454  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0630  copper resistance D domain-containing protein  91.61 
 
 		 310 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0252  copper resistance protein, putative  71.05 
 
 		 308 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2463  putative copper resistance protein  71.05 
 
 		 308 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0751  copper resistance family protein  71.05 
 
 		 308 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0917  putative transmembrane transporter protein  71.05 
 
 		 308 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.804185  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0739  copper resistance family protein  71.05 
 
 		 308 aa  334  1e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2382  putative copper resistance protein  71.05 
 
 		 308 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2695  putative copper resistance protein  71.05 
 
 		 308 aa  334  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0610  copper resistance protein, putative  70.72 
 
 		 308 aa  333  2e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0431  copper resistance D domain-containing protein  65.81 
 
 		 309 aa  333  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.121113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3306  copper resistance D domain protein  65.48 
 
 		 311 aa  315  9e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0653  putative copper-resistance transporter, CopD  65.48 
 
 		 309 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.819488  normal  0.721895 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0717  putative copper resistance protein D  38.7 
 
 		 314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190026  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2012  putative copper-resistance membrane protein  39.08 
 
 		 314 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3532  copper resistance D domain protein  32.08 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4608  copper resistance D domain protein  32.08 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1956  copper resistance protein, putative  38.91 
 
 		 315 aa  100  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0625  putative copper resistance protein D  39.08 
 
 		 315 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2037  copper resistance D domain-containing protein  34.92 
 
 		 313 aa  97.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6288  copper resistance D domain-containing protein  34.65 
 
 		 313 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.228159 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4099  copper resistance D domain-containing protein  35.05 
 
 		 313 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.441252 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3417  copper resistance D domain-containing protein  34.73 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4750  copper resistance D  34.73 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.433754  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3356  copper resistance D domain-containing protein  35.16 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5193  copper resistance D domain-containing protein  34.53 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2761  copper resistance protein D  34.31 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  26.5 
 
 		 364 aa  65.1  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  29.56 
 
 		 290 aa  57  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  29.56 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  29.56 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0547124 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  29.56 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  29.2 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  29.2 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  29.2 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2115  copper resistance protein D  29.2 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1347  copper resistance protein D  28.83 
 
 		 290 aa  52  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.579669  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  30.2 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  31.48 
 
 		 319 aa  50.8  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  27.21 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  28.51 
 
 		 316 aa  47  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  31.15 
 
 		 309 aa  46.2  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  31.25 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1944  copper resistance D domain-containing protein  37.6 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3413  copper resistance D domain-containing protein  33.64 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  27.24 
 
 		 291 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  27.24 
 
 		 291 aa  42.7  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  27.59 
 
 		 291 aa  42.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6115  copper resistance protein CopD  30 
 
 		 305 aa  42.4  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0426726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2125  copper resistance D domain protein  31.43 
 
 		 292 aa  42.4  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>