54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0431 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_0431  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 
309 aa  585  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.121113  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0653  putative copper-resistance transporter, CopD  79.94 
 
 
309 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.819488  normal  0.721895 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3306  copper resistance D domain protein  79.94 
 
 
311 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2667  copper resistance D domain-containing protein  67.74 
 
 
310 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2056  copper resistance D  67.74 
 
 
310 aa  333  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2696  copper resistance D domain-containing protein  67.74 
 
 
310 aa  332  5e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5995  copper resistance D  67.42 
 
 
310 aa  330  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2592  copper resistance D domain-containing protein  65.81 
 
 
310 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2720  copper resistance D domain-containing protein  65.81 
 
 
310 aa  330  3e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0630  copper resistance D domain-containing protein  65.81 
 
 
310 aa  325  6e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0917  putative transmembrane transporter protein  62.5 
 
 
308 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.804185  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2463  putative copper resistance protein  62.5 
 
 
308 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0252  copper resistance protein, putative  62.5 
 
 
308 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0751  copper resistance family protein  62.5 
 
 
308 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2695  putative copper resistance protein  62.5 
 
 
308 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2382  putative copper resistance protein  62.5 
 
 
308 aa  290  2e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0739  copper resistance family protein  62.5 
 
 
308 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0610  copper resistance protein, putative  62.17 
 
 
308 aa  289  4e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0717  putative copper resistance protein D  36.16 
 
 
314 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190026  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2012  putative copper-resistance membrane protein  36.25 
 
 
314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4608  copper resistance D domain protein  32.18 
 
 
314 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3532  copper resistance D domain protein  32.18 
 
 
314 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264949  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0625  putative copper resistance protein D  36.53 
 
 
315 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2037  copper resistance D domain-containing protein  32.81 
 
 
313 aa  89.4  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597966  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3356  copper resistance D domain-containing protein  33.66 
 
 
306 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2761  copper resistance protein D  33.22 
 
 
313 aa  86.3  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1956  copper resistance protein, putative  35.13 
 
 
315 aa  85.9  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4099  copper resistance D domain-containing protein  33.11 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.441252 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5193  copper resistance D domain-containing protein  33.33 
 
 
313 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216741  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6288  copper resistance D domain-containing protein  32.23 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.228159 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4750  copper resistance D  32.12 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.433754  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3417  copper resistance D domain-containing protein  32.12 
 
 
313 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  27.06 
 
 
364 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  31.8 
 
 
319 aa  54.7  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  30.31 
 
 
291 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  30.31 
 
 
291 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  29.89 
 
 
290 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  28.52 
 
 
290 aa  49.3  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  29.8 
 
 
290 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  29.8 
 
 
290 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0547124 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  29.8 
 
 
290 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  28.91 
 
 
290 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  29.6 
 
 
290 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  29.6 
 
 
290 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  30.31 
 
 
291 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  29.53 
 
 
291 aa  47.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1347  copper resistance protein D  29.41 
 
 
290 aa  47  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.579669  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  30.71 
 
 
291 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.792171 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2115  copper resistance protein D  29.41 
 
 
290 aa  46.2  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2346  copper resistance D domain-containing protein  32.79 
 
 
305 aa  46.2  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  36.45 
 
 
310 aa  44.3  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  41.53 
 
 
559 aa  44.3  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1944  copper resistance D domain-containing protein  33.06 
 
 
293 aa  43.5  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  30.1 
 
 
309 aa  42.7  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>