62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4099 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4099  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 
313 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.441252 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3417  copper resistance D domain-containing protein  96.17 
 
 
313 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4750  copper resistance D  96.17 
 
 
313 aa  541  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.433754  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2761  copper resistance protein D  87.82 
 
 
313 aa  507  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5193  copper resistance D domain-containing protein  83.97 
 
 
313 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216741  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3356  copper resistance D domain-containing protein  84.26 
 
 
306 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6288  copper resistance D domain-containing protein  70.29 
 
 
313 aa  409  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.228159 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2012  putative copper-resistance membrane protein  66.77 
 
 
314 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0717  putative copper resistance protein D  66.77 
 
 
314 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190026  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1956  copper resistance protein, putative  67.2 
 
 
315 aa  368  1e-101  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0625  putative copper resistance protein D  67.09 
 
 
315 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2037  copper resistance D domain-containing protein  60.7 
 
 
313 aa  331  8e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597966  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4608  copper resistance D domain protein  54.95 
 
 
314 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3532  copper resistance D domain protein  54.95 
 
 
314 aa  313  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264949  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  32.58 
 
 
364 aa  95.1  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5995  copper resistance D  36.01 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2720  copper resistance D domain-containing protein  35.37 
 
 
310 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2592  copper resistance D domain-containing protein  35.37 
 
 
310 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0431  copper resistance D domain-containing protein  33.44 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.121113  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2696  copper resistance D domain-containing protein  35.9 
 
 
310 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0630  copper resistance D domain-containing protein  34.41 
 
 
310 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2667  copper resistance D domain-containing protein  35.58 
 
 
310 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2056  copper resistance D  35.58 
 
 
310 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2695  putative copper resistance protein  35.39 
 
 
308 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2382  putative copper resistance protein  35.39 
 
 
308 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0739  copper resistance family protein  35.39 
 
 
308 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0751  copper resistance family protein  35.39 
 
 
308 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0917  putative transmembrane transporter protein  35.39 
 
 
308 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.804185  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2463  putative copper resistance protein  35.39 
 
 
308 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0252  copper resistance protein, putative  35.39 
 
 
308 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0610  copper resistance protein, putative  38.32 
 
 
308 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  26.83 
 
 
316 aa  53.5  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  31.47 
 
 
310 aa  52.8  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2060  copper resistance D domain protein  29.52 
 
 
400 aa  51.6  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  31.92 
 
 
299 aa  50.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3306  copper resistance D domain protein  31.79 
 
 
311 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6115  copper resistance protein CopD  32.82 
 
 
305 aa  49.7  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0426726  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  21.99 
 
 
549 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  35 
 
 
578 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  33.07 
 
 
309 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  31.34 
 
 
309 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  31.34 
 
 
309 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  29.91 
 
 
718 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  31.25 
 
 
565 aa  46.2  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  29.77 
 
 
343 aa  46.2  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0653  putative copper-resistance transporter, CopD  31.02 
 
 
309 aa  45.8  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.819488  normal  0.721895 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3813  copper resistance D  33.86 
 
 
287 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  20.33 
 
 
439 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00580  putative copper export protein  29.46 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  26.6 
 
 
290 aa  44.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  33.63 
 
 
310 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  20.33 
 
 
544 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  29.87 
 
 
663 aa  44.3  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  28.97 
 
 
718 aa  43.9  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  32.14 
 
 
564 aa  43.5  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  31.22 
 
 
309 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  19.92 
 
 
547 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  30.46 
 
 
560 aa  43.1  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  21.6 
 
 
544 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  21.6 
 
 
544 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  23.28 
 
 
290 aa  42.4  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0547124 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  23.28 
 
 
290 aa  42.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>