75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3813 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3813  copper resistance D  100 
 
 		 287 aa  543  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1496  copper resistance D  43.61 
 
 		 310 aa  230  2e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  43.52 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  41.53 
 
 		 309 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6115  copper resistance protein CopD  42.67 
 
 		 305 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0426726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  41.2 
 
 		 309 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  41.2 
 
 		 309 aa  189  4e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1837  copper resistance D domain protein  41.39 
 
 		 309 aa  186  5e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.124234  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  41.4 
 
 		 308 aa  185  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3413  copper resistance D domain-containing protein  37.13 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2486  copper resistance D  41.25 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.877356  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  40.79 
 
 		 299 aa  155  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0659  copper resistance D transmembrane protein  42.07 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2341  copper resistance D domain-containing protein  43.83 
 
 		 317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2346  copper resistance D domain-containing protein  39.34 
 
 		 305 aa  135  7.000000000000001e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  34.41 
 
 		 310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2426  copper resistance D  35.69 
 
 		 322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  35.14 
 
 		 290 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2164  copper resistance D domain protein  36.36 
 
 		 294 aa  96.3  6e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600658 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2924  copper resistance D  39.78 
 
 		 284 aa  93.6  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2338  copper resistance protein D  31.07 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.30506  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2237  copper resistance D domain protein  31.8 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  29.08 
 
 		 316 aa  78.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  38.33 
 
 		 319 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1622  copper resistance protein D  30.71 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.283422  normal  0.570002 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2436  copper resistance D domain-containing protein  30.71 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  34.46 
 
 		 309 aa  70.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  34.59 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4216  Cu resistance protein  35.2 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  28.1 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  27.51 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  27.51 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  27.51 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  31.62 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  32.34 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.792171 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3447  copper resistance D  32.75 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  25.08 
 
 		 290 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  25.08 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  25.08 
 
 		 290 aa  56.2  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0547124 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  26.09 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  25.08 
 
 		 290 aa  55.5  0.0000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  27.73 
 
 		 364 aa  55.8  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1347  copper resistance protein D  24.75 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.579669  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2115  copper resistance protein D  24.75 
 
 		 290 aa  53.5  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  24.41 
 
 		 290 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  24.41 
 
 		 290 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  27.43 
 
 		 927 aa  52  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1944  copper resistance D domain-containing protein  31.4 
 
 		 293 aa  52  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  29.48 
 
 		 651 aa  51.2  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2060  copper resistance D domain protein  30.83 
 
 		 400 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2288  copper resistance D  32.43 
 
 		 166 aa  49.7  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.600323  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  32.45 
 
 		 578 aa  49.3  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  32.63 
 
 		 547 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  28.47 
 
 		 544 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  31.31 
 
 		 439 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  32.73 
 
 		 613 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  31.31 
 
 		 544 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  31.31 
 
 		 549 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  31.31 
 
 		 544 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  31.31 
 
 		 544 aa  47  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  32.58 
 
 		 547 aa  46.6  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  32.63 
 
 		 547 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  27.08 
 
 		 549 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1742  copper resistance D  28.34 
 
 		 288 aa  45.8  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0121133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1972  copper resistance D domain-containing protein  29.87 
 
 		 306 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.910407  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  29.2 
 
 		 343 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1389  copper resistance D domain-containing protein  27.47 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4290  copper resistance D domain-containing protein  29.33 
 
 		 298 aa  43.1  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180937  normal  0.688919 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0252  copper resistance D domain-containing protein  29.33 
 
 		 298 aa  43.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.956933  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  26.46 
 
 		 702 aa  43.1  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6631  copper resistance D domain protein  29.04 
 
 		 283 aa  43.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  26.46 
 
 		 702 aa  43.1  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0467  copper resistance D domain protein  27.67 
 
 		 313 aa  42.7  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  29.48 
 
 		 687 aa  42.4  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0696  hypothetical protein  27.69 
 
 		 160 aa  42.4  0.01  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>