66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0467 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0467  copper resistance D domain protein  100 
 
 		 313 aa  596  1e-169  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  37.11 
 
 		 309 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  31.68 
 
 		 316 aa  100  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1944  copper resistance D domain-containing protein  34.55 
 
 		 293 aa  93.2  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  32.13 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  34.89 
 
 		 310 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4216  Cu resistance protein  36.67 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2338  copper resistance protein D  31.14 
 
 		 294 aa  80.5  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.30506  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3413  copper resistance D domain-containing protein  27.33 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1622  copper resistance protein D  31.14 
 
 		 294 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.283422  normal  0.570002 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  29.81 
 
 		 290 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  31.11 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2436  copper resistance D domain-containing protein  29.9 
 
 		 294 aa  79  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  29.49 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  29.49 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0547124 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6115  copper resistance protein CopD  33.33 
 
 		 305 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0426726  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  29.49 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  28.8 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  28.75 
 
 		 290 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  28.8 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2346  copper resistance D domain-containing protein  36.01 
 
 		 305 aa  77  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1347  copper resistance protein D  28.71 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.579669  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2115  copper resistance protein D  29.17 
 
 		 290 aa  75.5  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6631  copper resistance D domain protein  33.55 
 
 		 283 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  30.29 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  30.29 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  30.91 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  34.3 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  30.15 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1496  copper resistance D  29.07 
 
 		 310 aa  68.9  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  30.03 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  35.38 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  29.26 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  29.26 
 
 		 309 aa  66.2  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  29.26 
 
 		 309 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  26.02 
 
 		 718 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  29.93 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.792171 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2125  copper resistance D domain protein  32.5 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2426  copper resistance D  32.73 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  26.88 
 
 		 718 aa  58.9  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1837  copper resistance D domain protein  29.07 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.124234  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  32.65 
 
 		 578 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  28.38 
 
 		 308 aa  55.8  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2237  copper resistance D domain protein  29.85 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  35.71 
 
 		 310 aa  53.5  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  32.26 
 
 		 364 aa  53.1  0.000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  24.3 
 
 		 927 aa  52.8  0.000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  32.2 
 
 		 686 aa  50.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00580  putative copper export protein  36.24 
 
 		 343 aa  50.1  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2341  copper resistance D domain-containing protein  38.53 
 
 		 317 aa  50.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  35.34 
 
 		 708 aa  49.3  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  33.15 
 
 		 564 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3813  copper resistance D  30.18 
 
 		 287 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  32.24 
 
 		 687 aa  46.2  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  27.41 
 
 		 663 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  34.73 
 
 		 722 aa  45.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  28.42 
 
 		 547 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  32.26 
 
 		 565 aa  45.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0717  putative copper resistance protein D  33.12 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190026  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  28.84 
 
 		 613 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  34.32 
 
 		 697 aa  43.1  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  31.46 
 
 		 547 aa  43.5  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  27.86 
 
 		 549 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  28.42 
 
 		 544 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  28.42 
 
 		 544 aa  43.1  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2924  copper resistance D  34.66 
 
 		 284 aa  42.4  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>