83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1837 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1837  copper resistance D domain protein  100 
 
 		 309 aa  600  1.0000000000000001e-171  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.124234  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  95.15 
 
 		 309 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  74.11 
 
 		 309 aa  445  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  73.14 
 
 		 309 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  73.14 
 
 		 309 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  59.55 
 
 		 308 aa  337  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0659  copper resistance D transmembrane protein  66.23 
 
 		 309 aa  322  4e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6115  copper resistance protein CopD  55.78 
 
 		 305 aa  302  5.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0426726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1496  copper resistance D  48.05 
 
 		 310 aa  271  1e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  48.05 
 
 		 299 aa  247  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2486  copper resistance D  46.1 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.877356  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3413  copper resistance D domain-containing protein  38.36 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2341  copper resistance D domain-containing protein  45.83 
 
 		 317 aa  188  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  37.25 
 
 		 310 aa  161  2e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2346  copper resistance D domain-containing protein  39.26 
 
 		 305 aa  158  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3813  copper resistance D  41.43 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2426  copper resistance D  38.29 
 
 		 322 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  34.54 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2164  copper resistance D domain protein  37.79 
 
 		 294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600658 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2924  copper resistance D  38.06 
 
 		 284 aa  112  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  35.5 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  30.94 
 
 		 316 aa  94.7  2e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  34.84 
 
 		 309 aa  93.6  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  43.36 
 
 		 310 aa  90.1  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  31.56 
 
 		 290 aa  87.4  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1622  copper resistance protein D  30.88 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.283422  normal  0.570002 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2338  copper resistance protein D  30.88 
 
 		 294 aa  83.2  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.30506  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2436  copper resistance D domain-containing protein  30.88 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  30.29 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  30.29 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  30.29 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  30.29 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  29.04 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.792171 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  26.49 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2237  copper resistance D domain protein  31.94 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  27.27 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  26.16 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  26.16 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0547124 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  25.83 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  25.83 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  25.83 
 
 		 290 aa  72  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1347  copper resistance protein D  25.83 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.579669  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2115  copper resistance protein D  25.83 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1944  copper resistance D domain-containing protein  40.3 
 
 		 293 aa  69.3  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4216  Cu resistance protein  27.95 
 
 		 292 aa  67  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3447  copper resistance D  36.21 
 
 		 285 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2125  copper resistance D domain protein  24.28 
 
 		 292 aa  53.1  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2222  copper resistance D domain protein  34.9 
 
 		 302 aa  52.8  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  38.46 
 
 		 288 aa  52.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3356  copper resistance D domain-containing protein  32.66 
 
 		 306 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0717  putative copper resistance protein D  29.87 
 
 		 314 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190026  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  32.87 
 
 		 869 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1972  copper resistance D domain-containing protein  30.67 
 
 		 306 aa  50.4  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.910407  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5193  copper resistance D domain-containing protein  32.5 
 
 		 313 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  32.28 
 
 		 590 aa  50.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2012  putative copper-resistance membrane protein  30.3 
 
 		 314 aa  49.7  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  25.16 
 
 		 547 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  22 
 
 		 544 aa  49.7  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  27.67 
 
 		 544 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  29.41 
 
 		 551 aa  48.5  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  27.72 
 
 		 364 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0252  copper resistance D domain-containing protein  29.59 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.956933  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4290  copper resistance D domain-containing protein  29.59 
 
 		 298 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180937  normal  0.688919 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  24.53 
 
 		 549 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  30.99 
 
 		 564 aa  46.6  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  21.2 
 
 		 544 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  21.2 
 
 		 544 aa  46.2  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4608  copper resistance D domain protein  30.69 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3532  copper resistance D domain protein  30.69 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  29.82 
 
 		 565 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  21.9 
 
 		 547 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6631  copper resistance D domain protein  26.01 
 
 		 283 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  23.2 
 
 		 439 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  29.87 
 
 		 663 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  28.66 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  37.96 
 
 		 513 aa  44.3  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  31.58 
 
 		 547 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  22.27 
 
 		 549 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  31.52 
 
 		 578 aa  43.9  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00580  putative copper export protein  28.31 
 
 		 343 aa  43.5  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0467  copper resistance D domain protein  31.55 
 
 		 313 aa  42.7  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2060  copper resistance D domain protein  29.38 
 
 		 400 aa  42.7  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  35.11 
 
 		 539 aa  42.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>