45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2164 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2164  copper resistance D domain protein  100 
 
 		 294 aa  550  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600658 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  42.67 
 
 		 308 aa  132  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  38.13 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  39.6 
 
 		 299 aa  126  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  37.67 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  37.67 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  36.04 
 
 		 310 aa  123  3e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1837  copper resistance D domain protein  37.79 
 
 		 309 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.124234  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  36.67 
 
 		 309 aa  122  8e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2486  copper resistance D  39.94 
 
 		 303 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.877356  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6115  copper resistance protein CopD  35.74 
 
 		 305 aa  115  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0426726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1496  copper resistance D  33.88 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2346  copper resistance D domain-containing protein  39.93 
 
 		 305 aa  105  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3413  copper resistance D domain-containing protein  32.69 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2924  copper resistance D  38.06 
 
 		 284 aa  97.1  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3813  copper resistance D  40.94 
 
 		 287 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  35.9 
 
 		 290 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0659  copper resistance D transmembrane protein  38.33 
 
 		 309 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  39.2 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  29.41 
 
 		 316 aa  81.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2426  copper resistance D  41.4 
 
 		 322 aa  77.4  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2341  copper resistance D domain-containing protein  39.91 
 
 		 317 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  35.29 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  30.07 
 
 		 290 aa  60.8  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  31.16 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2436  copper resistance D domain-containing protein  31.91 
 
 		 294 aa  60.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  31.16 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  31.16 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  31.16 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  32.11 
 
 		 291 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.792171 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1622  copper resistance protein D  31.13 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.283422  normal  0.570002 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2338  copper resistance protein D  31.37 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.30506  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4216  Cu resistance protein  35.2 
 
 		 292 aa  58.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  35.94 
 
 		 310 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  22.39 
 
 		 927 aa  55.8  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  32.16 
 
 		 578 aa  53.5  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0252  copper resistance D domain-containing protein  26.97 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.956933  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4290  copper resistance D domain-containing protein  26.97 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180937  normal  0.688919 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1972  copper resistance D domain-containing protein  26.13 
 
 		 306 aa  49.3  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.910407  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2222  copper resistance D domain protein  35.1 
 
 		 302 aa  49.3  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1944  copper resistance D domain-containing protein  30.59 
 
 		 293 aa  48.1  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  38.18 
 
 		 288 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  30.41 
 
 		 663 aa  43.1  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  26.07 
 
 		 290 aa  43.1  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  35.21 
 
 		 687 aa  42.4  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>