25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_4290 on replicon NC_008573
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008573  Shewana3_4290  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 		 298 aa  579  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180937  normal  0.688919 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0252  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 		 298 aa  579  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.956933  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1972  copper resistance D domain-containing protein  93.46 
 
 		 306 aa  546  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.910407  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3543  copper resistance D  50 
 
 		 314 aa  269  4e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324754  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1389  copper resistance D domain-containing protein  41.91 
 
 		 296 aa  203  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00324  putative copper export protein  29.93 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.170745  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00389  putative copper export protein  33.56 
 
 		 295 aa  125  8.000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1742  copper resistance D  32.38 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0121133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  33.33 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2222  copper resistance D domain protein  30.69 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  34.09 
 
 		 299 aa  58.9  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0498  copper resistance D domain-containing protein  27.86 
 
 		 300 aa  57  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  31.53 
 
 		 310 aa  55.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6115  copper resistance protein CopD  28.43 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0426726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  32.95 
 
 		 309 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  32.43 
 
 		 309 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  32.43 
 
 		 309 aa  50.4  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2164  copper resistance D domain protein  25.52 
 
 		 294 aa  49.7  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1837  copper resistance D domain protein  29.59 
 
 		 309 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.124234  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  31.82 
 
 		 513 aa  48.5  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  30 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  32.43 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  25.84 
 
 		 316 aa  46.6  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  22.19 
 
 		 927 aa  43.1  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3813  copper resistance D  29.33 
 
 		 287 aa  43.1  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>