73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0444 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 		 308 aa  600  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  60.19 
 
 		 309 aa  355  3.9999999999999996e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  59.87 
 
 		 309 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  57.93 
 
 		 309 aa  345  4e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  57.93 
 
 		 309 aa  345  4e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1837  copper resistance D domain protein  59.55 
 
 		 309 aa  338  5.9999999999999996e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.124234  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6115  copper resistance protein CopD  57.05 
 
 		 305 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0426726  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0659  copper resistance D transmembrane protein  57.47 
 
 		 309 aa  268  8.999999999999999e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1496  copper resistance D  49.35 
 
 		 310 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3413  copper resistance D domain-containing protein  43.61 
 
 		 309 aa  237  2e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  49.03 
 
 		 299 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2486  copper resistance D  45.45 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.877356  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2341  copper resistance D domain-containing protein  45.98 
 
 		 317 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3813  copper resistance D  41.83 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  37.75 
 
 		 310 aa  151  2e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2346  copper resistance D domain-containing protein  37.42 
 
 		 305 aa  143  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2426  copper resistance D  38.24 
 
 		 322 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  33.22 
 
 		 290 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2164  copper resistance D domain protein  42.67 
 
 		 294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600658 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2924  copper resistance D  34.75 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  35.83 
 
 		 319 aa  101  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  33.23 
 
 		 309 aa  95.1  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2338  copper resistance protein D  29.96 
 
 		 294 aa  90.9  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.30506  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1622  copper resistance protein D  29.96 
 
 		 294 aa  89.4  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.283422  normal  0.570002 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  29.94 
 
 		 316 aa  87.4  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2436  copper resistance D domain-containing protein  29.96 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  33.46 
 
 		 310 aa  86.7  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  27.81 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  28.57 
 
 		 290 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  28.57 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0547124 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  28.57 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  28.57 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  28.57 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2237  copper resistance D domain protein  33.94 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1347  copper resistance protein D  27.52 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.579669  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  28.19 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  28.19 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  27.48 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2115  copper resistance protein D  28.19 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  27.48 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  27.48 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3447  copper resistance D  36.78 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4216  Cu resistance protein  32 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  27.1 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1944  copper resistance D domain-containing protein  36.57 
 
 		 293 aa  63.9  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  36.92 
 
 		 288 aa  58.9  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2222  copper resistance D domain protein  37.23 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  33.08 
 
 		 291 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.792171 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2125  copper resistance D domain protein  32.59 
 
 		 292 aa  54.7  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2060  copper resistance D domain protein  38.46 
 
 		 400 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1972  copper resistance D domain-containing protein  26.92 
 
 		 306 aa  53.1  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.910407  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  23.56 
 
 		 927 aa  51.6  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  31.38 
 
 		 613 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0252  copper resistance D domain-containing protein  30 
 
 		 298 aa  48.5  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.956933  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4290  copper resistance D domain-containing protein  30 
 
 		 298 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180937  normal  0.688919 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  28.12 
 
 		 663 aa  47  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  32.58 
 
 		 544 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00389  putative copper export protein  29.2 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  32.58 
 
 		 544 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00580  putative copper export protein  32.03 
 
 		 343 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  31.91 
 
 		 547 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1389  copper resistance D domain-containing protein  27.6 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3356  copper resistance D domain-containing protein  31.19 
 
 		 306 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  31.46 
 
 		 439 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3532  copper resistance D domain protein  29.87 
 
 		 314 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264949  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  31.46 
 
 		 544 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4608  copper resistance D domain protein  29.87 
 
 		 314 aa  43.1  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  31.46 
 
 		 544 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0946  copper resistance protein CopC  31.3 
 
 		 697 aa  42.7  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.116964  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5193  copper resistance D domain-containing protein  30.69 
 
 		 313 aa  42.7  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  28.3 
 
 		 551 aa  42.4  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6631  copper resistance D domain protein  26.35 
 
 		 283 aa  42.4  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  32.58 
 
 		 549 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>