90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1206 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 		 288 aa  538  9.999999999999999e-153  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2222  copper resistance D domain protein  57.93 
 
 		 302 aa  267  1e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0498  copper resistance D domain-containing protein  51.55 
 
 		 300 aa  186  5e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1742  copper resistance D  36.49 
 
 		 288 aa  103  4e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0121133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00389  putative copper export protein  35.4 
 
 		 295 aa  91.3  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1972  copper resistance D domain-containing protein  31.66 
 
 		 306 aa  84  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.910407  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4290  copper resistance D domain-containing protein  32.29 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180937  normal  0.688919 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0252  copper resistance D domain-containing protein  32.29 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.956933  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00324  putative copper export protein  27.74 
 
 		 304 aa  75.1  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.170745  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  40.14 
 
 		 576 aa  74.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2924  copper resistance D  43.22 
 
 		 284 aa  73.9  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  37.43 
 
 		 528 aa  69.7  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  36.36 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2596  copper resistance protein  39.72 
 
 		 512 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449295  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  39.39 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  41.5 
 
 		 539 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  33.65 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  36.25 
 
 		 519 aa  60.8  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  33.82 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  33.82 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1389  copper resistance D domain-containing protein  25.18 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  36.36 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  29.61 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2125  copper resistance D domain protein  34.04 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  38.24 
 
 		 290 aa  57  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  38.67 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  32.47 
 
 		 551 aa  56.6  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3413  copper resistance D domain-containing protein  37.21 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1837  copper resistance D domain protein  37.33 
 
 		 309 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.124234  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3543  copper resistance D  27.65 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324754  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1944  copper resistance D domain-containing protein  35.29 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  31.35 
 
 		 310 aa  53.9  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6115  copper resistance protein CopD  36.22 
 
 		 305 aa  53.1  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0426726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  28.37 
 
 		 319 aa  53.1  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  35.83 
 
 		 588 aa  52.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 613 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2338  copper resistance protein D  29.27 
 
 		 294 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.30506  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0659  copper resistance D transmembrane protein  39.34 
 
 		 309 aa  51.6  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  35.77 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  34.58 
 
 		 692 aa  51.2  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1496  copper resistance D  31.61 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  36.46 
 
 		 590 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  35.21 
 
 		 299 aa  50.1  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  38.46 
 
 		 513 aa  50.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1622  copper resistance protein D  30.07 
 
 		 294 aa  49.7  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.283422  normal  0.570002 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4216  Cu resistance protein  33.61 
 
 		 292 aa  49.7  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2436  copper resistance D domain-containing protein  29.27 
 
 		 294 aa  49.7  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  32.08 
 
 		 291 aa  49.7  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  32.08 
 
 		 291 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  35.29 
 
 		 364 aa  49.3  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  32.08 
 
 		 291 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  32.08 
 
 		 291 aa  49.3  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  33.64 
 
 		 291 aa  49.3  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.792171 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00580  putative copper export protein  30.68 
 
 		 343 aa  48.5  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  32.59 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  31.85 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2115  copper resistance protein D  31.85 
 
 		 290 aa  47.4  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  36.97 
 
 		 869 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2346  copper resistance D domain-containing protein  38.05 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  27.42 
 
 		 547 aa  47.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  21.71 
 
 		 927 aa  48.1  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1347  copper resistance protein D  31.85 
 
 		 290 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.579669  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  33.05 
 
 		 607 aa  47.8  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  25.17 
 
 		 544 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  31.85 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0547124 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2164  copper resistance D domain protein  35.76 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600658 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  31.85 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  31.85 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  31.85 
 
 		 290 aa  47  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  31.85 
 
 		 290 aa  47  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5053  copper resistance D  38.18 
 
 		 309 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.659373  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5141  copper resistance D domain-containing protein  38.18 
 
 		 309 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2486  copper resistance D  38.51 
 
 		 303 aa  46.2  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.877356  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2426  copper resistance D  35.51 
 
 		 322 aa  46.2  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  29.33 
 
 		 559 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  29.08 
 
 		 439 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  28.06 
 
 		 544 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  29.79 
 
 		 549 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  24.49 
 
 		 544 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  28.06 
 
 		 544 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5432  copper resistance D domain-containing protein  37.27 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165296  normal  0.69712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0957  copper resistance D domain-containing protein  34.71 
 
 		 510 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.39722  normal  0.0782365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6631  copper resistance D domain protein  43.08 
 
 		 283 aa  45.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0807  copper resistance protein  28.85 
 
 		 559 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14159  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  28.06 
 
 		 686 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  23.89 
 
 		 547 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7241  copper resistance protein CopC  32.23 
 
 		 649 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000107682  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  25.17 
 
 		 547 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  25.17 
 
 		 549 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  34.21 
 
 		 718 aa  43.1  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>