201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2596 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2596  copper resistance protein  100 
 
 		 512 aa  966    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449295  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  65.89 
 
 		 528 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2198  copper resistance D  53.22 
 
 		 519 aa  449  1e-125  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  51.68 
 
 		 539 aa  372  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  43.33 
 
 		 576 aa  281  2e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  39.84 
 
 		 513 aa  202  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  28.98 
 
 		 560 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  26.81 
 
 		 564 aa  95.9  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  29.78 
 
 		 551 aa  95.5  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2222  copper resistance D domain protein  39.86 
 
 		 302 aa  76.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  20.22 
 
 		 549 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  39.86 
 
 		 288 aa  75.5  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7241  copper resistance protein CopC  24.21 
 
 		 649 aa  75.9  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000107682  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  19.96 
 
 		 544 aa  74.7  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  27.94 
 
 		 607 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  19.71 
 
 		 544 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  19.71 
 
 		 544 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  19.67 
 
 		 544 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  27.74 
 
 		 869 aa  71.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  19.3 
 
 		 547 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  19.52 
 
 		 547 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0197  copper resistance protein CopC  44.21 
 
 		 244 aa  69.7  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  19.85 
 
 		 547 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5386  copper resistance protein CopC  41.13 
 
 		 170 aa  67.8  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.370102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5659  copper resistance protein CopC  41.13 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.531469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  26.8 
 
 		 571 aa  67  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  36.09 
 
 		 678 aa  66.6  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  19.3 
 
 		 549 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3714  copper resistance protein CopC  42.42 
 
 		 226 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  37.01 
 
 		 664 aa  65.9  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5351  copper resistance protein CopC  42.42 
 
 		 226 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2338  copper resistance protein D  30.14 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.30506  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1726  copper resistance protein CopC  42 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.889834  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0566  copper resistance protein CopC  37.86 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  33.61 
 
 		 588 aa  63.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2591  copper resistance protein CopC  36.36 
 
 		 196 aa  62.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2807  copper resistance protein CopC  42.42 
 
 		 229 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2636  cell wall anchor domain-containing protein  36.8 
 
 		 173 aa  62.4  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1622  copper resistance protein D  29.68 
 
 		 294 aa  62  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.283422  normal  0.570002 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  40.4 
 
 		 578 aa  62  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2794  copper resistance protein CopC  38.38 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2436  copper resistance D domain-containing protein  29.68 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6847  conserved hypothetical protein of Cu resistance protein CopC-like protein  37.89 
 
 		 188 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24410  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  37.76 
 
 		 214 aa  61.6  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0208823  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4480  copper resistance protein CopC  30.38 
 
 		 632 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427384  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  36.79 
 
 		 565 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1028  copper resistance protein CopC  34.26 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0204789 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  40.78 
 
 		 559 aa  60.5  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  32.77 
 
 		 687 aa  60.5  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4442  copper resistance protein CopC  36.89 
 
 		 424 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5776  copper resistance protein CopC  26.92 
 
 		 577 aa  59.7  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83623  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  29.52 
 
 		 686 aa  59.7  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  36.2 
 
 		 290 aa  60.1  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  20.7 
 
 		 927 aa  59.7  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  31.89 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00389  putative copper export protein  32.48 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  30.32 
 
 		 290 aa  58.9  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  31.89 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1971  copper resistance protein CopC  34.65 
 
 		 140 aa  57.8  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.520942  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  31.89 
 
 		 309 aa  57.8  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1127  copper resistance protein CopC  41.05 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.035308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5005  copper resistance protein CopC  40.68 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2502  copper resistance protein CopC  32.08 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.422344  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2170  copper resistance protein, putative  37.14 
 
 		 144 aa  57  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.117129  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0041  copper resistance protein CopC  37.14 
 
 		 182 aa  57  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  33.91 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1275  copper resistance protein CopC  36.56 
 
 		 605 aa  57  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.453103  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4536  copper resistance protein CopC  36.89 
 
 		 189 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.450196 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  30.4 
 
 		 364 aa  56.6  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3378  copper resistance protein CopC  37.11 
 
 		 284 aa  55.8  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0755618  hitchhiker  0.00467806 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3307  copper resistance protein CopC  35.58 
 
 		 111 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.980594 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3270  copper resistance protein CopC  36.63 
 
 		 225 aa  55.5  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  31.21 
 
 		 687 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00324  putative copper export protein  31.82 
 
 		 304 aa  55.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.170745  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2789  copper resistance protein CopC  37.96 
 
 		 197 aa  55.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0441468  hitchhiker  0.000669635 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3510  copper resistance protein CopC  34.59 
 
 		 172 aa  55.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  34.07 
 
 		 310 aa  55.5  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2163  copper resistance protein CopC  38.68 
 
 		 125 aa  55.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.856375  normal  0.693909 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1160  copper resistance protein CopC  33.03 
 
 		 180 aa  55.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4289  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 140 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.379862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0251  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 140 aa  55.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1496  copper resistance D  30.46 
 
 		 310 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06090  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  32.99 
 
 		 233 aa  54.7  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0652  putative copper resistance protein, CopC  36.63 
 
 		 125 aa  54.3  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.652987 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4100  copper resistance protein CopC  36.19 
 
 		 126 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4751  copper resistance protein CopC  36.19 
 
 		 126 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.420513  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3416  copper resistance protein CopC  36.19 
 
 		 126 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0298  Cu resistance protein CopC  32.99 
 
 		 210 aa  53.9  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1067  copper resistance protein CopC  29.96 
 
 		 593 aa  53.9  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  33.61 
 
 		 681 aa  53.5  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  31.48 
 
 		 613 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  30.18 
 
 		 651 aa  53.5  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00600  uncharacterized protein, copper resistance protein CopC-like protein  36.89 
 
 		 197 aa  53.5  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3531  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 143 aa  53.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0355537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1972  copper resistance D domain-containing protein  27.31 
 
 		 306 aa  53.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.910407  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4607  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 122 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  38 
 
 		 663 aa  52  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4290  copper resistance D domain-containing protein  28.35 
 
 		 298 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180937  normal  0.688919 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  33.33 
 
 		 671 aa  52.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4567  copper resistance protein CopC  38.26 
 
 		 272 aa  52.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>