34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00324 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00324  putative copper export protein  100 
 
 		 304 aa  606  9.999999999999999e-173  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.170745  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1389  copper resistance D domain-containing protein  32.35 
 
 		 296 aa  154  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00389  putative copper export protein  34.65 
 
 		 295 aa  142  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1972  copper resistance D domain-containing protein  31.41 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.910407  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0252  copper resistance D domain-containing protein  29.93 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.956933  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4290  copper resistance D domain-containing protein  29.93 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180937  normal  0.688919 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3543  copper resistance D  33.87 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324754  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2222  copper resistance D domain protein  28.57 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1742  copper resistance D  28.1 
 
 		 288 aa  71.6  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0121133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  33.81 
 
 		 288 aa  64.3  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  31.97 
 
 		 316 aa  57  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2346  copper resistance D domain-containing protein  28.35 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  33.02 
 
 		 310 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  30.97 
 
 		 528 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  26.03 
 
 		 290 aa  49.3  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0498  copper resistance D domain-containing protein  27.42 
 
 		 300 aa  49.3  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  25.16 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6115  copper resistance protein CopD  32.56 
 
 		 305 aa  46.6  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0426726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  24.39 
 
 		 290 aa  46.6  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  25.8 
 
 		 290 aa  45.8  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7241  copper resistance protein CopC  32.17 
 
 		 649 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000107682  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  30.66 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  24.8 
 
 		 290 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  23.93 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  24.8 
 
 		 290 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1347  copper resistance protein D  23.93 
 
 		 290 aa  43.5  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.579669  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2115  copper resistance protein D  24.29 
 
 		 290 aa  43.9  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  24.29 
 
 		 290 aa  43.9  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0547124 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  24.29 
 
 		 290 aa  43.9  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  23.89 
 
 		 290 aa  43.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  24.06 
 
 		 291 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  26.28 
 
 		 678 aa  42.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  23.31 
 
 		 309 aa  42.4  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  23.31 
 
 		 309 aa  42.4  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>