47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1742 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1742  copper resistance D  100 
 
 		 288 aa  543  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0121133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00389  putative copper export protein  31.42 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  35.53 
 
 		 288 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1389  copper resistance D domain-containing protein  31.77 
 
 		 296 aa  93.2  4e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0498  copper resistance D domain-containing protein  39.59 
 
 		 300 aa  93.2  4e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2222  copper resistance D domain protein  36.52 
 
 		 302 aa  93.2  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1972  copper resistance D domain-containing protein  29.25 
 
 		 306 aa  90.5  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.910407  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4290  copper resistance D domain-containing protein  32.38 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180937  normal  0.688919 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0252  copper resistance D domain-containing protein  32.38 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.956933  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00324  putative copper export protein  28.43 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.170745  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3543  copper resistance D  28.43 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324754  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  38.1 
 
 		 576 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  38.68 
 
 		 310 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  28.46 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  28.46 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  32.08 
 
 		 319 aa  52  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  35.92 
 
 		 309 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  29.27 
 
 		 309 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  38.46 
 
 		 539 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  27.41 
 
 		 291 aa  48.9  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  28.02 
 
 		 316 aa  48.9  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  31.76 
 
 		 310 aa  47.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2426  copper resistance D  33.64 
 
 		 322 aa  47.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  27.34 
 
 		 291 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  34.38 
 
 		 290 aa  46.2  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  27.34 
 
 		 291 aa  46.2  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  31.16 
 
 		 290 aa  45.8  0.0009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  31.16 
 
 		 290 aa  45.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0547124 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  31.16 
 
 		 290 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  31.16 
 
 		 290 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  31.16 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  31.16 
 
 		 290 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  31.16 
 
 		 290 aa  45.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2164  copper resistance D domain protein  31.54 
 
 		 294 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600658 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2115  copper resistance protein D  31.16 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1347  copper resistance protein D  31.16 
 
 		 290 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.579669  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1944  copper resistance D domain-containing protein  29.75 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  30.93 
 
 		 528 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1622  copper resistance protein D  28.02 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.283422  normal  0.570002 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  27.7 
 
 		 291 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2436  copper resistance D domain-containing protein  28.02 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2596  copper resistance protein  33.85 
 
 		 512 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449295  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2338  copper resistance protein D  28.02 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.30506  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5430  copper resistance protein CopC  32.37 
 
 		 552 aa  43.1  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982748  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  33 
 
 		 290 aa  43.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  33.62 
 
 		 309 aa  42.7  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2125  copper resistance D domain protein  29.69 
 
 		 292 aa  42.4  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>