43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5430 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5430  copper resistance protein CopC  100 
 
 		 552 aa  1077    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982748  normal  0.283558 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4020  copper resistance D  40.47 
 
 		 546 aa  355  8.999999999999999e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1741  copper resistance D  36.91 
 
 		 550 aa  237  4e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0807  copper resistance protein  33.33 
 
 		 559 aa  218  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14159  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  31.62 
 
 		 613 aa  66.6  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  29.73 
 
 		 564 aa  61.2  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2513  hypothetical protein  31.83 
 
 		 621 aa  59.7  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  29.57 
 
 		 565 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  25.67 
 
 		 319 aa  56.6  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  29.8 
 
 		 663 aa  55.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  33.1 
 
 		 290 aa  54.7  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  29.85 
 
 		 578 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  23.28 
 
 		 547 aa  52  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  35.04 
 
 		 310 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  29.5 
 
 		 291 aa  51.2  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  28.78 
 
 		 291 aa  50.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1742  copper resistance D  35.71 
 
 		 288 aa  50.4  0.00007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0121133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  28.78 
 
 		 291 aa  50.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  28.78 
 
 		 291 aa  50.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  33.94 
 
 		 687 aa  50.4  0.00009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  28.78 
 
 		 291 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.792171 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  25.68 
 
 		 547 aa  48.5  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  23.44 
 
 		 544 aa  47.8  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  23.44 
 
 		 544 aa  47.8  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  30.88 
 
 		 288 aa  47.4  0.0006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0946  copper resistance protein CopC  27.27 
 
 		 697 aa  47.4  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.116964  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  27.67 
 
 		 571 aa  47.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  27.34 
 
 		 544 aa  47.4  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  27.33 
 
 		 364 aa  47  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  24.51 
 
 		 547 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  30.58 
 
 		 576 aa  47  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  23.44 
 
 		 439 aa  47  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  27.34 
 
 		 544 aa  46.6  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2222  copper resistance D domain protein  33.1 
 
 		 302 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2060  copper resistance D domain protein  33.33 
 
 		 400 aa  45.8  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  26.56 
 
 		 549 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  21.56 
 
 		 549 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  33.11 
 
 		 590 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  30.57 
 
 		 309 aa  44.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1126  copper resistance D domain-containing protein  33.03 
 
 		 297 aa  45.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2486  copper resistance D  28.95 
 
 		 303 aa  44.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.877356  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  21.43 
 
 		 927 aa  44.7  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  27.63 
 
 		 310 aa  43.5  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>