32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1972 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1972  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 		 306 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.910407  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0252  copper resistance D domain-containing protein  93.46 
 
 		 298 aa  546  1e-154  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.956933  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4290  copper resistance D domain-containing protein  93.46 
 
 		 298 aa  546  1e-154  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180937  normal  0.688919 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3543  copper resistance D  48.56 
 
 		 314 aa  264  1e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324754  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1389  copper resistance D domain-containing protein  40.51 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00324  putative copper export protein  31.41 
 
 		 304 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.170745  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00389  putative copper export protein  33.99 
 
 		 295 aa  121  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1742  copper resistance D  28.57 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0121133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  32.5 
 
 		 288 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2222  copper resistance D domain protein  30.92 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  32.95 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  33.33 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  33.33 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  30.54 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0498  copper resistance D domain-containing protein  27.43 
 
 		 300 aa  55.8  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  32.14 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  26.92 
 
 		 308 aa  53.5  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6115  copper resistance protein CopD  27.86 
 
 		 305 aa  53.1  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0426726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  24.6 
 
 		 316 aa  52.4  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  31.33 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1837  copper resistance D domain protein  30.67 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.124234  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3413  copper resistance D domain-containing protein  24.12 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2164  copper resistance D domain protein  24.91 
 
 		 294 aa  46.6  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600658 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  25.99 
 
 		 613 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2346  copper resistance D domain-containing protein  25.55 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  21.92 
 
 		 927 aa  45.4  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  28.38 
 
 		 319 aa  44.3  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3813  copper resistance D  29.87 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  23.03 
 
 		 590 aa  44.3  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2486  copper resistance D  24.61 
 
 		 303 aa  43.5  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.877356  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  24.32 
 
 		 309 aa  42.7  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  25.95 
 
 		 310 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>