70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2346 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2346  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 		 305 aa  566  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  38.93 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1837  copper resistance D domain protein  39.26 
 
 		 309 aa  159  5e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.124234  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  37.46 
 
 		 309 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  37.12 
 
 		 309 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  37.12 
 
 		 309 aa  150  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  37.19 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1496  copper resistance D  37.54 
 
 		 310 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6115  copper resistance protein CopD  37.91 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0426726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2486  copper resistance D  39.4 
 
 		 303 aa  143  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.877356  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  38.21 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3413  copper resistance D domain-containing protein  32.14 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  37.34 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  38.39 
 
 		 309 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  37.3 
 
 		 290 aa  122  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  34.5 
 
 		 316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3813  copper resistance D  44.44 
 
 		 287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  39.27 
 
 		 310 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2924  copper resistance D  40.82 
 
 		 284 aa  112  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2341  copper resistance D domain-containing protein  41.64 
 
 		 317 aa  109  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2164  copper resistance D domain protein  39.27 
 
 		 294 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600658 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0659  copper resistance D transmembrane protein  42.54 
 
 		 309 aa  102  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  38.52 
 
 		 319 aa  100  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2426  copper resistance D  40.68 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4216  Cu resistance protein  33.33 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2436  copper resistance D domain-containing protein  28.68 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1622  copper resistance protein D  28.29 
 
 		 294 aa  79.7  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.283422  normal  0.570002 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2338  copper resistance protein D  28.29 
 
 		 294 aa  79  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.30506  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3447  copper resistance D  35.33 
 
 		 285 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  27.94 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0467  copper resistance D domain protein  36.01 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2237  copper resistance D domain protein  30.58 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  31.95 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.792171 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  22.85 
 
 		 927 aa  63.2  0.000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  31.36 
 
 		 291 aa  62.4  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  36.04 
 
 		 565 aa  62.4  0.000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  27.18 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  34.72 
 
 		 564 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  31.36 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  31.36 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6631  copper resistance D domain protein  32.79 
 
 		 283 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2060  copper resistance D domain protein  37.9 
 
 		 400 aa  59.3  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  26.77 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00324  putative copper export protein  28.32 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.170745  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  26.45 
 
 		 290 aa  55.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  26.45 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0547124 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  26.45 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1944  copper resistance D domain-containing protein  29.18 
 
 		 293 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  26.45 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1972  copper resistance D domain-containing protein  25.55 
 
 		 306 aa  53.9  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.910407  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1347  copper resistance protein D  26.13 
 
 		 290 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.579669  normal  0.306332 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  25.49 
 
 		 290 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  25.49 
 
 		 290 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2115  copper resistance protein D  26.13 
 
 		 290 aa  52.8  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  27.02 
 
 		 364 aa  52.4  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  29.3 
 
 		 613 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3543  copper resistance D  32.98 
 
 		 314 aa  50.8  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.324754  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2125  copper resistance D domain protein  29.23 
 
 		 292 aa  50.1  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0252  copper resistance D domain-containing protein  26.22 
 
 		 298 aa  49.7  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.956933  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4290  copper resistance D domain-containing protein  26.22 
 
 		 298 aa  49.7  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180937  normal  0.688919 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  34.62 
 
 		 288 aa  48.9  0.00009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  31.43 
 
 		 578 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  29.49 
 
 		 590 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  27.45 
 
 		 547 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0447  protein of unknown function DUF474  24.22 
 
 		 149 aa  44.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136192  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  23.67 
 
 		 702 aa  43.5  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  23.67 
 
 		 702 aa  43.5  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  33.66 
 
 		 439 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  33.66 
 
 		 544 aa  42.7  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  26.12 
 
 		 544 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>