71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1496 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1496  copper resistance D  100 
 
 		 310 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  48.36 
 
 		 309 aa  276  4e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1837  copper resistance D domain protein  47.37 
 
 		 309 aa  264  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.124234  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  44.74 
 
 		 309 aa  248  6e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  43.75 
 
 		 309 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  43.75 
 
 		 309 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6115  copper resistance protein CopD  46.91 
 
 		 305 aa  241  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0426726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  49.35 
 
 		 308 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3413  copper resistance D domain-containing protein  38.56 
 
 		 309 aa  216  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0659  copper resistance D transmembrane protein  46.71 
 
 		 309 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2341  copper resistance D domain-containing protein  48.06 
 
 		 317 aa  199  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3813  copper resistance D  42.86 
 
 		 287 aa  190  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  42.11 
 
 		 299 aa  191  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2486  copper resistance D  42.02 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.877356  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  39.3 
 
 		 310 aa  168  9e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2426  copper resistance D  38.92 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2346  copper resistance D domain-containing protein  37.54 
 
 		 305 aa  134  1.9999999999999998e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2924  copper resistance D  39.79 
 
 		 284 aa  103  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2164  copper resistance D domain protein  33.11 
 
 		 294 aa  102  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600658 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  29.74 
 
 		 290 aa  96.7  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  32.7 
 
 		 310 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  30.15 
 
 		 290 aa  81.6  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  29.75 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  29.47 
 
 		 290 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  29.87 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  29.47 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  29.47 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0547124 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  29.47 
 
 		 290 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  29.87 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  29.14 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  29.14 
 
 		 290 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2115  copper resistance protein D  29.14 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1347  copper resistance protein D  29.55 
 
 		 290 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.579669  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  33.15 
 
 		 319 aa  73.6  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2338  copper resistance protein D  29.09 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.30506  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1944  copper resistance D domain-containing protein  35.09 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1622  copper resistance protein D  29.09 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.283422  normal  0.570002 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  28.66 
 
 		 291 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  28.38 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  28.25 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  28.25 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2237  copper resistance D domain protein  31.22 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  27.04 
 
 		 291 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.792171 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2436  copper resistance D domain-containing protein  28.67 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4216  Cu resistance protein  28.42 
 
 		 292 aa  57  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  24.71 
 
 		 927 aa  55.8  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0946  copper resistance protein CopC  33.16 
 
 		 697 aa  54.3  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.116964  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  30.41 
 
 		 288 aa  50.4  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6631  copper resistance D domain protein  27.97 
 
 		 283 aa  50.1  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2012  putative copper-resistance membrane protein  31.94 
 
 		 314 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  30.38 
 
 		 551 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  23.69 
 
 		 544 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0717  putative copper resistance protein D  31.56 
 
 		 314 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190026  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2222  copper resistance D domain protein  31.01 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3532  copper resistance D domain protein  29.26 
 
 		 314 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4608  copper resistance D domain protein  29.26 
 
 		 314 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  30.16 
 
 		 364 aa  46.2  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  23.08 
 
 		 544 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  23.08 
 
 		 544 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  30 
 
 		 343 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0467  copper resistance D domain protein  36.11 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1500  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 590 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5782  copper resistance protein CopC  31.91 
 
 		 869 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  22.89 
 
 		 439 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  23.46 
 
 		 549 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  23.26 
 
 		 549 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  26.74 
 
 		 687 aa  43.1  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  22.89 
 
 		 547 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  22.76 
 
 		 547 aa  43.1  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  24.4 
 
 		 547 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  31.52 
 
 		 544 aa  42.4  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>