54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3532 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3532  copper resistance D domain protein  100 
 
 		 314 aa  614  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4608  copper resistance D domain protein  100 
 
 		 314 aa  614  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2012  putative copper-resistance membrane protein  57.32 
 
 		 314 aa  335  7e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0717  putative copper resistance protein D  57.01 
 
 		 314 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190026  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0625  putative copper resistance protein D  57.64 
 
 		 315 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2761  copper resistance protein D  56.87 
 
 		 313 aa  311  9e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1956  copper resistance protein, putative  56.19 
 
 		 315 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5193  copper resistance D domain-containing protein  58.79 
 
 		 313 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3356  copper resistance D domain-containing protein  59.54 
 
 		 306 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3417  copper resistance D domain-containing protein  55.91 
 
 		 313 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4750  copper resistance D  55.91 
 
 		 313 aa  293  3e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.433754  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4099  copper resistance D domain-containing protein  54.95 
 
 		 313 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.441252 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6288  copper resistance D domain-containing protein  52.72 
 
 		 313 aa  290  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.228159 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2037  copper resistance D domain-containing protein  49.52 
 
 		 313 aa  271  7e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  29.23 
 
 		 364 aa  97.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2720  copper resistance D domain-containing protein  32.27 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2592  copper resistance D domain-containing protein  32.27 
 
 		 310 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0630  copper resistance D domain-containing protein  33.02 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0431  copper resistance D domain-containing protein  32.18 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.121113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5995  copper resistance D  32.41 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0610  copper resistance protein, putative  33.22 
 
 		 308 aa  67  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2463  putative copper resistance protein  32.9 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0751  copper resistance family protein  32.9 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0739  copper resistance family protein  32.9 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2382  putative copper resistance protein  32.9 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0252  copper resistance protein, putative  32.9 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0917  putative transmembrane transporter protein  32.9 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.804185  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2695  putative copper resistance protein  32.9 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2696  copper resistance D domain-containing protein  32.2 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2667  copper resistance D domain-containing protein  31.89 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2056  copper resistance D  31.89 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  29.43 
 
 		 316 aa  62  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  37.69 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  36.84 
 
 		 565 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2426  copper resistance D  28.26 
 
 		 322 aa  54.3  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  36.84 
 
 		 564 aa  53.9  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  37.78 
 
 		 588 aa  52  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  34.62 
 
 		 578 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  32.26 
 
 		 560 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  32 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3306  copper resistance D domain protein  29.52 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  32.74 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0653  putative copper-resistance transporter, CopD  28.8 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.819488  normal  0.721895 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  32.89 
 
 		 299 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1496  copper resistance D  29.26 
 
 		 310 aa  47  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  35.35 
 
 		 559 aa  47  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7241  copper resistance protein CopC  46.15 
 
 		 649 aa  45.8  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000107682  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  33.85 
 
 		 309 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  33.08 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  33.08 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  27.74 
 
 		 290 aa  45.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  30.58 
 
 		 309 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  29.87 
 
 		 308 aa  43.1  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2060  copper resistance D domain protein  27.5 
 
 		 400 aa  42.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>