52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2060 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2060  copper resistance D domain protein  100 
 
 		 400 aa  768    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  34.27 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0717  putative copper resistance protein D  31.55 
 
 		 314 aa  54.3  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190026  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  36.56 
 
 		 578 aa  53.9  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2012  putative copper-resistance membrane protein  31.55 
 
 		 314 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  33.57 
 
 		 560 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  34.78 
 
 		 310 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  31.33 
 
 		 316 aa  53.9  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5141  copper resistance D domain-containing protein  34.86 
 
 		 309 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.375904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5053  copper resistance D  34.86 
 
 		 309 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.659373  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  38.46 
 
 		 308 aa  53.5  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5432  copper resistance D domain-containing protein  34.86 
 
 		 309 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.165296  normal  0.69712 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  29.08 
 
 		 364 aa  52.4  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  30.5 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  36.21 
 
 		 309 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  33.09 
 
 		 299 aa  50.8  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3813  copper resistance D  30.83 
 
 		 287 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  39.02 
 
 		 588 aa  49.7  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  31.6 
 
 		 679 aa  49.3  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1602  copper resistance D domain-containing protein  36.13 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.265845 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6631  copper resistance D domain protein  37.5 
 
 		 283 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6115  copper resistance protein CopD  30.88 
 
 		 305 aa  49.3  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0426726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  35.34 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  35.34 
 
 		 309 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2486  copper resistance D  34.62 
 
 		 303 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.877356  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0946  copper resistance protein CopC  34.96 
 
 		 697 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.116964  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0625  putative copper resistance protein D  31.55 
 
 		 315 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  33.33 
 
 		 672 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  30.66 
 
 		 290 aa  46.2  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  33.1 
 
 		 687 aa  46.2  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  33.33 
 
 		 559 aa  45.8  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2346  copper resistance D domain-containing protein  36.77 
 
 		 305 aa  46.2  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  31.58 
 
 		 547 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  30.53 
 
 		 681 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  25.45 
 
 		 571 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  29.25 
 
 		 613 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2037  copper resistance D domain-containing protein  29.88 
 
 		 313 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4099  copper resistance D domain-containing protein  29.52 
 
 		 313 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.441252 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6288  copper resistance D domain-containing protein  27.5 
 
 		 313 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.228159 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  33.68 
 
 		 547 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  30.53 
 
 		 549 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  31.21 
 
 		 651 aa  43.9  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  31.06 
 
 		 565 aa  43.9  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5193  copper resistance D domain-containing protein  31.93 
 
 		 313 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  30.53 
 
 		 544 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  30.53 
 
 		 544 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  30.53 
 
 		 544 aa  43.5  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  30.53 
 
 		 544 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5680  copper resistance D domain-containing protein  34.02 
 
 		 307 aa  43.5  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0027818 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  31.58 
 
 		 549 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  28.14 
 
 		 663 aa  43.1  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  31.58 
 
 		 547 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>