68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2486 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2486  copper resistance D  100 
 
 		 303 aa  588  1e-167  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.877356  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  47.73 
 
 		 309 aa  251  1e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6115  copper resistance protein CopD  50.49 
 
 		 305 aa  244  9.999999999999999e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0426726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1837  copper resistance D domain protein  47.4 
 
 		 309 aa  241  7.999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.124234  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  49.35 
 
 		 309 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  49.35 
 
 		 309 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  48.38 
 
 		 309 aa  239  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  50.97 
 
 		 299 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  46.43 
 
 		 308 aa  219  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1496  copper resistance D  43.18 
 
 		 310 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0659  copper resistance D transmembrane protein  48.05 
 
 		 309 aa  198  9e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3413  copper resistance D domain-containing protein  37.34 
 
 		 309 aa  175  9e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2341  copper resistance D domain-containing protein  45.16 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3813  copper resistance D  42.91 
 
 		 287 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2346  copper resistance D domain-containing protein  39.93 
 
 		 305 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  38.64 
 
 		 310 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2164  copper resistance D domain protein  39.3 
 
 		 294 aa  126  4.0000000000000003e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.600658 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2426  copper resistance D  35.83 
 
 		 322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  36.51 
 
 		 290 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2924  copper resistance D  37.5 
 
 		 284 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  31.17 
 
 		 316 aa  106  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  34.41 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  30.97 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  32.96 
 
 		 290 aa  90.5  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  31.25 
 
 		 291 aa  84.7  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  31.25 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  31.25 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  31.58 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  38.46 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2338  copper resistance protein D  32.07 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.30506  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2436  copper resistance D domain-containing protein  32.07 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1622  copper resistance protein D  32.07 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.283422  normal  0.570002 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  30.13 
 
 		 291 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.792171 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  27.45 
 
 		 290 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  27.45 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  27.45 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  27.45 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0547124 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  27.45 
 
 		 290 aa  73.2  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  27.04 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  27.04 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1347  copper resistance protein D  27.12 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.579669  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2115  copper resistance protein D  27.12 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2237  copper resistance D domain protein  29.43 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  25.71 
 
 		 927 aa  60.1  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2125  copper resistance D domain protein  29.41 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  28 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0419  copper resistance D domain-containing protein  32.57 
 
 		 576 aa  57  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.080355  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  39.53 
 
 		 288 aa  56.6  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4216  Cu resistance protein  30.16 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3447  copper resistance D  29.2 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2060  copper resistance D domain protein  34.03 
 
 		 400 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1944  copper resistance D domain-containing protein  30.11 
 
 		 293 aa  52.8  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2222  copper resistance D domain protein  34.69 
 
 		 302 aa  51.2  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1972  copper resistance D domain-containing protein  24.77 
 
 		 306 aa  51.6  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.910407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  35.96 
 
 		 547 aa  48.9  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0252  copper resistance D domain-containing protein  25 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.956933  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4290  copper resistance D domain-containing protein  25 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180937  normal  0.688919 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  29.82 
 
 		 676 aa  47  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  31.37 
 
 		 547 aa  47  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  30.52 
 
 		 663 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1742  copper resistance D  29.92 
 
 		 288 aa  43.5  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0121133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  24.56 
 
 		 439 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  25.47 
 
 		 544 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  29.01 
 
 		 343 aa  43.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  25.47 
 
 		 544 aa  43.1  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  31.52 
 
 		 549 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2037  copper resistance D domain-containing protein  32.49 
 
 		 313 aa  42.7  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5430  copper resistance protein CopC  28.95 
 
 		 552 aa  42.7  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.982748  normal  0.283558 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>