76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2341 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_2341  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 
317 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312055  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1496  copper resistance D  48.06 
 
 
310 aa  259  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  46.79 
 
 
309 aa  249  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  45.19 
 
 
309 aa  239  4e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  43.91 
 
 
309 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  43.91 
 
 
309 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1837  copper resistance D domain protein  45.83 
 
 
309 aa  236  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.124234  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  47.91 
 
 
308 aa  226  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6115  copper resistance protein CopD  46.1 
 
 
305 aa  219  3e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0426726  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3413  copper resistance D domain-containing protein  39.34 
 
 
309 aa  207  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0659  copper resistance D transmembrane protein  48.86 
 
 
309 aa  192  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  44.01 
 
 
299 aa  190  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2486  copper resistance D  43.87 
 
 
303 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.877356  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3813  copper resistance D  42.7 
 
 
287 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  38.91 
 
 
310 aa  152  8e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2426  copper resistance D  40.38 
 
 
322 aa  146  5e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2346  copper resistance D domain-containing protein  39.74 
 
 
305 aa  146  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  34.06 
 
 
309 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  32.46 
 
 
290 aa  110  3e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2164  copper resistance D domain protein  36.42 
 
 
294 aa  109  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.600658 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  36.17 
 
 
310 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  33.65 
 
 
316 aa  100  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2924  copper resistance D  33.44 
 
 
284 aa  99  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  34.11 
 
 
319 aa  94  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  29.81 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1622  copper resistance protein D  30.8 
 
 
294 aa  82.4  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.283422  normal  0.570002 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2436  copper resistance D domain-containing protein  30.8 
 
 
294 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2338  copper resistance protein D  30.8 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.30506  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1944  copper resistance D domain-containing protein  30.62 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2237  copper resistance D domain protein  32.89 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  28.21 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0547124 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  28.21 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1347  copper resistance protein D  28.06 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.579669  normal  0.306332 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  28.21 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  28.53 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  28.06 
 
 
290 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  27.74 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  27.74 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2115  copper resistance protein D  27.88 
 
 
290 aa  69.3  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  29.14 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  29.14 
 
 
291 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  29.6 
 
 
291 aa  67  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4216  Cu resistance protein  33.5 
 
 
292 aa  66.6  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  28.78 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  28.42 
 
 
291 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.792171 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0467  copper resistance D domain protein  31.13 
 
 
313 aa  64.3  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  24.1 
 
 
547 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  35.58 
 
 
551 aa  57  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  25.19 
 
 
927 aa  54.7  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  23.6 
 
 
544 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  23.29 
 
 
544 aa  53.1  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  28.29 
 
 
364 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3447  copper resistance D  32.16 
 
 
285 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  31.48 
 
 
663 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  22.62 
 
 
549 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2060  copper resistance D domain protein  31.58 
 
 
400 aa  50.1  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  22.8 
 
 
439 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1972  copper resistance D domain-containing protein  27.27 
 
 
306 aa  49.3  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.910407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  23.69 
 
 
547 aa  49.3  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  22.49 
 
 
544 aa  49.3  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  22.49 
 
 
544 aa  49.3  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  22.49 
 
 
547 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2125  copper resistance D domain protein  30.08 
 
 
292 aa  48.1  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1122  copper resistance protein CopC  34.35 
 
 
607 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.747822 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  22.49 
 
 
549 aa  47  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00580  putative copper export protein  28.12 
 
 
343 aa  47  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00389  putative copper export protein  28.76 
 
 
295 aa  46.2  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0717  putative copper resistance protein D  28.36 
 
 
314 aa  46.2  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190026  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  29.38 
 
 
578 aa  45.8  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2760  cytochrome c, class I  25.59 
 
 
702 aa  45.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2320  cytochrome c, class I  25.59 
 
 
702 aa  45.8  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1742  copper resistance D  34.19 
 
 
288 aa  44.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0121133  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  30.49 
 
 
343 aa  43.9  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2222  copper resistance D domain protein  31.41 
 
 
302 aa  43.5  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0252  copper resistance D domain-containing protein  26.26 
 
 
298 aa  42.7  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.956933  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4290  copper resistance D domain-containing protein  26.26 
 
 
298 aa  42.7  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.180937  normal  0.688919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>