57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2115 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E2115  copper resistance protein D  100 
 
 		 290 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  99.31 
 
 		 290 aa  569  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  99.66 
 
 		 290 aa  570  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0547124 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  99.66 
 
 		 290 aa  570  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  98.62 
 
 		 290 aa  565  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  98.62 
 
 		 290 aa  564  1e-160  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1347  copper resistance protein D  98.28 
 
 		 290 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.579669  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  97.93 
 
 		 290 aa  559  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  97.93 
 
 		 290 aa  559  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  64.83 
 
 		 291 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  64.83 
 
 		 291 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  64.83 
 
 		 291 aa  379  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  64.48 
 
 		 291 aa  377  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  64.83 
 
 		 291 aa  364  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.792171 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  54.83 
 
 		 290 aa  322  5e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2338  copper resistance protein D  40.21 
 
 		 294 aa  181  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.30506  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2436  copper resistance D domain-containing protein  39.86 
 
 		 294 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1622  copper resistance protein D  39.86 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.283422  normal  0.570002 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1944  copper resistance D domain-containing protein  38.83 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2237  copper resistance D domain protein  37.24 
 
 		 291 aa  154  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2125  copper resistance D domain protein  38.11 
 
 		 292 aa  135  7.000000000000001e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4216  Cu resistance protein  34.47 
 
 		 292 aa  125  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  28.3 
 
 		 316 aa  107  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  30.13 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  29.03 
 
 		 319 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  27.72 
 
 		 309 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  30.36 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  28.62 
 
 		 290 aa  75.1  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1496  copper resistance D  29.14 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  26.07 
 
 		 309 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3413  copper resistance D domain-containing protein  26.14 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6115  copper resistance protein CopD  26.91 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0426726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  26.07 
 
 		 309 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  26.07 
 
 		 309 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3447  copper resistance D  29.97 
 
 		 285 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2924  copper resistance D  29.9 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  27.18 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1837  copper resistance D domain protein  25.83 
 
 		 309 aa  63.9  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.124234  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2426  copper resistance D  26.79 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  28.16 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  25.34 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2486  copper resistance D  26.84 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.877356  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2222  copper resistance D domain protein  34.29 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6631  copper resistance D domain protein  33.33 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0467  copper resistance D domain protein  29.17 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  26.86 
 
 		 718 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  32.67 
 
 		 663 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3813  copper resistance D  30.13 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2346  copper resistance D domain-containing protein  25.73 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  34.26 
 
 		 288 aa  46.6  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00389  putative copper export protein  25.1 
 
 		 295 aa  46.6  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  23.33 
 
 		 697 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  27.89 
 
 		 687 aa  44.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00324  putative copper export protein  24.29 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.170745  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  50.88 
 
 		 513 aa  43.5  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0659  copper resistance D transmembrane protein  26.71 
 
 		 309 aa  43.9  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  27.92 
 
 		 549 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>