67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2411 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 
290 aa  574  1.0000000000000001e-163  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  60 
 
 
291 aa  350  2e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  60 
 
 
291 aa  349  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  60 
 
 
291 aa  349  3e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  59.66 
 
 
291 aa  348  9e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  60 
 
 
291 aa  338  5.9999999999999996e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.792171 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  55.52 
 
 
290 aa  325  6e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  55.17 
 
 
290 aa  323  1e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0547124 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  55.17 
 
 
290 aa  323  1e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  54.83 
 
 
290 aa  323  2e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1347  copper resistance protein D  55.17 
 
 
290 aa  323  3e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.579669  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  55.17 
 
 
290 aa  322  4e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2115  copper resistance protein D  54.83 
 
 
290 aa  322  5e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  54.48 
 
 
290 aa  318  5e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  54.48 
 
 
290 aa  318  5e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1944  copper resistance D domain-containing protein  45.17 
 
 
293 aa  206  5e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2338  copper resistance protein D  40.48 
 
 
294 aa  182  5.0000000000000004e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.30506  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2436  copper resistance D domain-containing protein  40.14 
 
 
294 aa  180  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1622  copper resistance protein D  40.14 
 
 
294 aa  180  2.9999999999999997e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.283422  normal  0.570002 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2237  copper resistance D domain protein  40.07 
 
 
291 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2125  copper resistance D domain protein  42.66 
 
 
292 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4216  Cu resistance protein  35.37 
 
 
292 aa  133  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  28.94 
 
 
316 aa  106  6e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  30.65 
 
 
309 aa  95.9  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  32.32 
 
 
309 aa  92.4  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  29.93 
 
 
309 aa  89.4  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  31.3 
 
 
309 aa  86.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  31.3 
 
 
309 aa  86.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1837  copper resistance D domain protein  29.23 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.124234  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1496  copper resistance D  30.15 
 
 
310 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  27.83 
 
 
319 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6115  copper resistance protein CopD  30.47 
 
 
305 aa  81.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0426726  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  34.19 
 
 
310 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2426  copper resistance D  30.8 
 
 
322 aa  79  0.00000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  37.6 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  28.12 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  28.18 
 
 
299 aa  74.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2486  copper resistance D  31.15 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.877356  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0467  copper resistance D domain protein  31.48 
 
 
313 aa  72.8  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3447  copper resistance D  29.21 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.13077 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2924  copper resistance D  32.86 
 
 
284 aa  68.9  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  27.49 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0659  copper resistance D transmembrane protein  32.57 
 
 
309 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2346  copper resistance D domain-containing protein  27.57 
 
 
305 aa  63.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3413  copper resistance D domain-containing protein  30.05 
 
 
309 aa  61.2  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6631  copper resistance D domain protein  38.99 
 
 
283 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  38.24 
 
 
288 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2222  copper resistance D domain protein  36.3 
 
 
302 aa  57.4  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.16421  normal  0.244581 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2426  copper resistance D  36.88 
 
 
539 aa  55.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.441884  normal  0.0848378 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3813  copper resistance D  37.4 
 
 
287 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5008  copper resistance protein CopC  34.9 
 
 
513 aa  53.1  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  40.4 
 
 
528 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2164  copper resistance D domain protein  29.74 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.600658 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  27.75 
 
 
364 aa  50.1  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00389  putative copper export protein  26.85 
 
 
295 aa  49.3  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  30.28 
 
 
692 aa  49.3  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  29.75 
 
 
708 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  28.74 
 
 
687 aa  47  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00324  putative copper export protein  25.8 
 
 
304 aa  45.8  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.170745  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  25.71 
 
 
718 aa  45.8  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4608  copper resistance D domain protein  27.74 
 
 
314 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3532  copper resistance D domain protein  27.74 
 
 
314 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264949  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6288  copper resistance D domain-containing protein  28.91 
 
 
313 aa  43.5  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.228159 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1742  copper resistance D  27.35 
 
 
288 aa  43.5  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0121133  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0717  putative copper resistance protein D  27.71 
 
 
314 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190026  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2596  copper resistance protein  34.31 
 
 
512 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.449295  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  29.46 
 
 
343 aa  42.7  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>