86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2651 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  100 
 
 		 364 aa  732    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3532  copper resistance D domain protein  29.23 
 
 		 314 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4608  copper resistance D domain protein  29.23 
 
 		 314 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0717  putative copper resistance protein D  34.25 
 
 		 314 aa  93.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190026  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2012  putative copper-resistance membrane protein  34.25 
 
 		 314 aa  93.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6288  copper resistance D domain-containing protein  33.33 
 
 		 313 aa  89.7  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.228159 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3356  copper resistance D domain-containing protein  31.3 
 
 		 306 aa  87  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2761  copper resistance protein D  30.2 
 
 		 313 aa  86.7  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5193  copper resistance D domain-containing protein  31.13 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0625  putative copper resistance protein D  34.81 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2037  copper resistance D domain-containing protein  30.77 
 
 		 313 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1956  copper resistance protein, putative  33.33 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3417  copper resistance D domain-containing protein  32.58 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4750  copper resistance D  32.58 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.433754  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4099  copper resistance D domain-containing protein  30.57 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.441252 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  25.7 
 
 		 927 aa  70.1  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0178  hypothetical protein  53.57 
 
 		 76 aa  67  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  34.09 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  26.14 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3413  copper resistance D domain-containing protein  29.38 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  30.61 
 
 		 588 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  30.51 
 
 		 578 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  31.22 
 
 		 565 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  24.55 
 
 		 316 aa  57  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1126  copper resistance protein CopC  33.01 
 
 		 560 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  32.31 
 
 		 692 aa  55.1  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  35.82 
 
 		 564 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  31.53 
 
 		 291 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  26.01 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  32.02 
 
 		 291 aa  54.3  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  29.37 
 
 		 613 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3813  copper resistance D  26.36 
 
 		 287 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2060  copper resistance D domain protein  29.08 
 
 		 400 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1622  copper resistance protein D  29.41 
 
 		 294 aa  52.8  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.283422  normal  0.570002 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  31.15 
 
 		 571 aa  52.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2436  copper resistance D domain-containing protein  29.41 
 
 		 294 aa  52.8  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  31.22 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  31.03 
 
 		 291 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  31.03 
 
 		 291 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0946  copper resistance protein CopC  29.33 
 
 		 697 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.116964  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00389  putative copper export protein  25.17 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  26.2 
 
 		 547 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  25.13 
 
 		 547 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  29.51 
 
 		 722 aa  51.2  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  26.7 
 
 		 544 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  26.7 
 
 		 544 aa  51.2  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2338  copper resistance protein D  27.96 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.30506  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  25.13 
 
 		 439 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3277  copper resistance protein CopC  31.2 
 
 		 528 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.862624  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  27.88 
 
 		 309 aa  50.4  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  27.75 
 
 		 290 aa  50.1  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  29.35 
 
 		 309 aa  50.1  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1206  copper resistance D domain-containing protein  35.29 
 
 		 288 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1734  hypothetical protein  29.7 
 
 		 165 aa  48.9  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  28.86 
 
 		 291 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.792171 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0630  copper resistance D domain-containing protein  28 
 
 		 310 aa  49.3  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  30.48 
 
 		 309 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  25.88 
 
 		 544 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2592  copper resistance D domain-containing protein  26.5 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  30.48 
 
 		 309 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2720  copper resistance D domain-containing protein  26.5 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2426  copper resistance D  29.23 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  25.88 
 
 		 547 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2696  copper resistance D domain-containing protein  29.28 
 
 		 310 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4174  copper resistance protein CopC  28.12 
 
 		 559 aa  47  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  29.5 
 
 		 681 aa  47  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1496  copper resistance D  30.16 
 
 		 310 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6115  copper resistance protein CopD  29.19 
 
 		 305 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0426726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1944  copper resistance D domain-containing protein  30 
 
 		 293 aa  45.4  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2056  copper resistance D  28.73 
 
 		 310 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  24.06 
 
 		 544 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2924  copper resistance D  25.14 
 
 		 284 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2667  copper resistance D domain-containing protein  28.73 
 
 		 310 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  30.99 
 
 		 651 aa  44.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  29.85 
 
 		 663 aa  44.7  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6631  copper resistance D domain protein  33.73 
 
 		 283 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  31.45 
 
 		 664 aa  43.5  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1837  copper resistance D domain protein  27.72 
 
 		 309 aa  43.5  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.124234  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  28.45 
 
 		 551 aa  43.5  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7241  copper resistance protein CopC  28.03 
 
 		 649 aa  43.5  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.0000107682  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  24.73 
 
 		 549 aa  43.1  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5995  copper resistance D  28.18 
 
 		 310 aa  43.1  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2346  copper resistance D domain-containing protein  27.02 
 
 		 305 aa  43.1  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  32.31 
 
 		 651 aa  43.1  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  24.06 
 
 		 549 aa  42.7  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  29.6 
 
 		 299 aa  42.7  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>