50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2667 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_2667  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 		 310 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2696  copper resistance D domain-containing protein  99.68 
 
 		 310 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2056  copper resistance D  100 
 
 		 310 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5995  copper resistance D  95.81 
 
 		 310 aa  478  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2592  copper resistance D domain-containing protein  91.61 
 
 		 310 aa  474  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2720  copper resistance D domain-containing protein  91.61 
 
 		 310 aa  474  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0630  copper resistance D domain-containing protein  89.68 
 
 		 310 aa  448  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0610  copper resistance protein, putative  72.7 
 
 		 308 aa  348  6e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0431  copper resistance D domain-containing protein  67.74 
 
 		 309 aa  343  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.121113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0751  copper resistance family protein  71.71 
 
 		 308 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0739  copper resistance family protein  71.71 
 
 		 308 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2382  putative copper resistance protein  71.71 
 
 		 308 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2695  putative copper resistance protein  71.71 
 
 		 308 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2463  putative copper resistance protein  71.71 
 
 		 308 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0917  putative transmembrane transporter protein  71.71 
 
 		 308 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.804185  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0252  copper resistance protein, putative  71.71 
 
 		 308 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0653  putative copper-resistance transporter, CopD  65.81 
 
 		 309 aa  317  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.819488  normal  0.721895 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3306  copper resistance D domain protein  65.48 
 
 		 311 aa  315  6e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0717  putative copper resistance protein D  37.46 
 
 		 314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190026  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2012  putative copper-resistance membrane protein  37.54 
 
 		 314 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2037  copper resistance D domain-containing protein  35.22 
 
 		 313 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3532  copper resistance D domain protein  31.89 
 
 		 314 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4608  copper resistance D domain protein  31.89 
 
 		 314 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1956  copper resistance protein, putative  37.94 
 
 		 315 aa  95.5  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0625  putative copper resistance protein D  37.54 
 
 		 315 aa  95.5  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6288  copper resistance D domain-containing protein  34.84 
 
 		 313 aa  89.7  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.228159 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3356  copper resistance D domain-containing protein  34.97 
 
 		 306 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5193  copper resistance D domain-containing protein  34.53 
 
 		 313 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4099  copper resistance D domain-containing protein  35.58 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.441252 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3417  copper resistance D domain-containing protein  34.73 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4750  copper resistance D  34.73 
 
 		 313 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.433754  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2761  copper resistance protein D  35.06 
 
 		 313 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  27.5 
 
 		 364 aa  64.7  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  29.88 
 
 		 308 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  30.3 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  29.52 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0547124 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  32.54 
 
 		 319 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  29.52 
 
 		 290 aa  50.8  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  29.52 
 
 		 290 aa  50.4  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  29.15 
 
 		 290 aa  49.7  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  30.26 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  30.26 
 
 		 290 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2115  copper resistance protein D  30.15 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1347  copper resistance protein D  28.78 
 
 		 290 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.579669  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  35.97 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1944  copper resistance D domain-containing protein  36.8 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  31.71 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  31.71 
 
 		 310 aa  43.5  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  29.3 
 
 		 290 aa  43.1  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  32.23 
 
 		 718 aa  42.4  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>