51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2037 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010622  Bphy_2037  copper resistance D domain-containing protein  100 
 
 
313 aa  610  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597966  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2012  putative copper-resistance membrane protein  61.98 
 
 
314 aa  364  1e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0717  putative copper resistance protein D  61.98 
 
 
314 aa  363  3e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190026  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6288  copper resistance D domain-containing protein  63.14 
 
 
313 aa  356  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.228159 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1956  copper resistance protein, putative  62.22 
 
 
315 aa  349  4e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0625  putative copper resistance protein D  62.3 
 
 
315 aa  349  4e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2761  copper resistance protein D  59.94 
 
 
313 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4099  copper resistance D domain-containing protein  60.7 
 
 
313 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.441252 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5193  copper resistance D domain-containing protein  59.62 
 
 
313 aa  333  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216741  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3356  copper resistance D domain-containing protein  59.74 
 
 
306 aa  326  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4750  copper resistance D  59.74 
 
 
313 aa  326  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.433754  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3417  copper resistance D domain-containing protein  59.74 
 
 
313 aa  326  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3532  copper resistance D domain protein  49.52 
 
 
314 aa  295  5e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264949  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4608  copper resistance D domain protein  49.52 
 
 
314 aa  295  5e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  35.97 
 
 
364 aa  99.4  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2720  copper resistance D domain-containing protein  34.73 
 
 
310 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2592  copper resistance D domain-containing protein  34.73 
 
 
310 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2696  copper resistance D domain-containing protein  34.29 
 
 
310 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2667  copper resistance D domain-containing protein  34.29 
 
 
310 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2056  copper resistance D  34.29 
 
 
310 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5995  copper resistance D  34.29 
 
 
310 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0630  copper resistance D domain-containing protein  32.05 
 
 
310 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0431  copper resistance D domain-containing protein  32.81 
 
 
309 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.121113  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0917  putative transmembrane transporter protein  32.34 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.804185  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0252  copper resistance protein, putative  32.34 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2463  putative copper resistance protein  32.34 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2695  putative copper resistance protein  32.34 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2382  putative copper resistance protein  32.34 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0739  copper resistance family protein  32.34 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0751  copper resistance family protein  32.34 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0610  copper resistance protein, putative  32.23 
 
 
308 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3306  copper resistance D domain protein  31.61 
 
 
311 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0653  putative copper-resistance transporter, CopD  31.29 
 
 
309 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.819488  normal  0.721895 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2060  copper resistance D domain protein  32.34 
 
 
400 aa  55.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5668  copper resistance protein D  32.07 
 
 
299 aa  52.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.276467  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  31.88 
 
 
578 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5103  copper resistance D domain protein  30.2 
 
 
309 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.013846 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  24.11 
 
 
927 aa  47.8  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  29.7 
 
 
309 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4480  copper resistance protein CopC  35.71 
 
 
632 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427384  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  29.7 
 
 
309 aa  47  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  30.82 
 
 
613 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2635  copper resistance protein CopC  29.19 
 
 
571 aa  46.6  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6115  copper resistance protein CopD  27.62 
 
 
305 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0426726  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1837  copper resistance D domain protein  31.08 
 
 
309 aa  44.3  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.124234  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0114  copper resistance protein D  30.23 
 
 
309 aa  43.9  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0946  copper resistance protein CopC  31.38 
 
 
697 aa  43.9  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.116964  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1776  copper resistance D domain protein  29.21 
 
 
309 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0404803  normal  0.203133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3202  copper resistance protein CopC  35.23 
 
 
588 aa  43.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543765  normal  0.0172994 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2346  copper resistance D domain-containing protein  30.48 
 
 
305 aa  43.1  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6631  copper resistance D domain protein  34.38 
 
 
283 aa  42.7  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>