62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_2463 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0252  copper resistance protein, putative  100 
 
 
308 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0917  putative transmembrane transporter protein  100 
 
 
308 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.804185  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2463  putative copper resistance protein  100 
 
 
308 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0751  copper resistance family protein  100 
 
 
308 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0739  copper resistance family protein  100 
 
 
308 aa  569  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2382  putative copper resistance protein  100 
 
 
308 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2695  putative copper resistance protein  100 
 
 
308 aa  569  1e-161  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0610  copper resistance protein, putative  95.45 
 
 
308 aa  454  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2592  copper resistance D domain-containing protein  71.05 
 
 
310 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2720  copper resistance D domain-containing protein  71.05 
 
 
310 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5995  copper resistance D  72.7 
 
 
310 aa  355  5e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.212016 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0630  copper resistance D domain-containing protein  72.37 
 
 
310 aa  352  5e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2696  copper resistance D domain-containing protein  72.04 
 
 
310 aa  351  8.999999999999999e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2056  copper resistance D  71.71 
 
 
310 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2667  copper resistance D domain-containing protein  71.71 
 
 
310 aa  350  1e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0431  copper resistance D domain-containing protein  62.5 
 
 
309 aa  312  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.121113  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0653  putative copper-resistance transporter, CopD  62.83 
 
 
309 aa  297  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.819488  normal  0.721895 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3306  copper resistance D domain protein  62.83 
 
 
311 aa  296  3e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0717  putative copper resistance protein D  37.54 
 
 
314 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.190026  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2012  putative copper-resistance membrane protein  37.46 
 
 
314 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3532  copper resistance D domain protein  32.9 
 
 
314 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.264949  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4608  copper resistance D domain protein  32.9 
 
 
314 aa  94.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1956  copper resistance protein, putative  37.46 
 
 
315 aa  87  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0625  putative copper resistance protein D  37.79 
 
 
315 aa  85.9  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2037  copper resistance D domain-containing protein  32.23 
 
 
313 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.597966  normal 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6288  copper resistance D domain-containing protein  33.12 
 
 
313 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.228159 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3417  copper resistance D domain-containing protein  34.75 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4750  copper resistance D  34.75 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.433754  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4099  copper resistance D domain-containing protein  34.64 
 
 
313 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.441252 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3356  copper resistance D domain-containing protein  35.2 
 
 
306 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2761  copper resistance protein D  34.88 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5193  copper resistance D domain-containing protein  34.21 
 
 
313 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.216741  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  29.27 
 
 
364 aa  69.3  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2575  copper resistance protein D  29.35 
 
 
290 aa  59.7  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.711615  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2069  copper resistance protein D  29.71 
 
 
290 aa  59.3  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1931  copper resistance protein D  29.71 
 
 
290 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1792  copper resistance D domain-containing protein  29.71 
 
 
290 aa  59.3  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0547124 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1802  copper resistance D domain protein  29.71 
 
 
290 aa  58.9  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.959003  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01799  hypothetical protein  29.35 
 
 
290 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01811  predicted inner membrane protein  29.35 
 
 
290 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2115  copper resistance protein D  29.35 
 
 
290 aa  56.6  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1347  copper resistance protein D  28.99 
 
 
290 aa  54.3  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.579669  normal  0.306332 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1375  copper resistance protein D  30.15 
 
 
291 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4397  copper resistance D  30.71 
 
 
319 aa  53.1  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00389  putative copper export protein  23.17 
 
 
295 aa  52  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  30 
 
 
310 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6631  copper resistance D domain protein  43.06 
 
 
283 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2033  copper resistance protein D  29.39 
 
 
291 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.18455 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2088  copper resistance protein D  29.39 
 
 
291 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.44493  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1250  copper resistance protein D  29.39 
 
 
291 aa  50.1  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  30.47 
 
 
310 aa  49.7  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2346  copper resistance D domain-containing protein  34.3 
 
 
305 aa  47.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3413  copper resistance D domain-containing protein  29.31 
 
 
309 aa  47  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  29.17 
 
 
316 aa  47.4  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2028  copper resistance protein D  29.77 
 
 
291 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.792171 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1013  copper resistance protein CopC  33.54 
 
 
551 aa  44.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113748  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2411  copper resistance D domain-containing protein  28.06 
 
 
290 aa  44.3  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1496  copper resistance D  28.99 
 
 
310 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  27.89 
 
 
308 aa  43.5  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2288  copper resistance D  35.14 
 
 
166 aa  43.5  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.600323  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6115  copper resistance protein CopD  29.25 
 
 
305 aa  43.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0426726  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3813  copper resistance D  30.32 
 
 
287 aa  42.4  0.01  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.874975 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>