17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2288 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2288  copper resistance D  100 
 
 		 166 aa  319  9.999999999999999e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.600323  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2155  copper resistance D  37.88 
 
 		 164 aa  68.9  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.976167  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0447  protein of unknown function DUF474  30.26 
 
 		 149 aa  67.4  0.00000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136192  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1279  protein of unknown function DUF474  34.51 
 
 		 149 aa  61.2  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352216  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3242  hypothetical protein  33.33 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.365102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3813  copper resistance D  32.43 
 
 		 287 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1734  hypothetical protein  27.33 
 
 		 165 aa  48.5  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3413  copper resistance D domain-containing protein  26.8 
 
 		 309 aa  47  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  33.02 
 
 		 613 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2795  hypothetical protein  30.72 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3627  hypothetical protein  28.57 
 
 		 149 aa  44.3  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105374  normal  0.900637 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1837  copper resistance D domain protein  29.8 
 
 		 309 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.124234  hitchhiker  0.000179935 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0444  copper resistance D domain-containing protein  30.13 
 
 		 308 aa  41.2  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2617  copper resistance D domain-containing protein  32.5 
 
 		 290 aa  40.8  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.893845 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1722  copper resistance D domain protein  29.87 
 
 		 309 aa  40.4  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.53795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  28.83 
 
 		 364 aa  40.8  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5339  copper resistance D domain protein  29.87 
 
 		 309 aa  40.4  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>