36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1734 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1734  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  324  3e-88  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2155  copper resistance D  33.03 
 
 
164 aa  57.8  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.976167  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2141  copper resistance D  28.47 
 
 
310 aa  56.2  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0947534  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0408  hypothetical protein  36.26 
 
 
157 aa  50.4  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2651  copper resistance protein, putative  29.7 
 
 
364 aa  48.9  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.352675  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1203  hypothetical protein  37.1 
 
 
158 aa  48.9  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.415138  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  28.85 
 
 
547 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0447  protein of unknown function DUF474  31.48 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136192  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0696  hypothetical protein  25.69 
 
 
160 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  27.89 
 
 
578 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1912  hypothetical protein  28.85 
 
 
544 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0106079  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1118  copper resistance protein CopC  35.05 
 
 
663 aa  46.6  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  31.73 
 
 
549 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1774  hypothetical protein  28.85 
 
 
544 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3474  copper resistance D domain-containing protein  27.27 
 
 
316 aa  46.6  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19492  normal  0.258562 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1279  protein of unknown function DUF474  32.43 
 
 
149 aa  45.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  28.85 
 
 
547 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3235  hypothetical protein  28.97 
 
 
133 aa  45.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.980786  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  29.81 
 
 
549 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  29.81 
 
 
544 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1786  copper resistance D domain-containing protein  29.81 
 
 
547 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0445487  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1949  hypothetical protein  30.77 
 
 
439 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.98353e-19 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1753  copper resistance protein  30.77 
 
 
544 aa  44.3  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00167581  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  26.85 
 
 
613 aa  42  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4061  hypothetical protein  36.36 
 
 
148 aa  42.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1989  hypothetical protein  27.36 
 
 
137 aa  42.4  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.198765  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3564  hypothetical protein  29.91 
 
 
133 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0807  copper resistance protein  28.93 
 
 
559 aa  42  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14159  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4480  copper resistance protein CopC  32.98 
 
 
632 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.427384  normal  0.536935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4251  hypothetical protein  29.91 
 
 
145 aa  41.6  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615167  normal  0.215178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3627  hypothetical protein  29.13 
 
 
149 aa  41.2  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105374  normal  0.900637 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1742  copper resistance D  31 
 
 
288 aa  41.2  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0121133  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3571  copper resistance protein CopC  31.58 
 
 
564 aa  41.2  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.632207  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3973  copper resistance protein CopC  31.58 
 
 
565 aa  41.2  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455106  normal  0.334703 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0946  copper resistance protein CopC  26.37 
 
 
697 aa  40.8  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.116964  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0620  hypothetical protein  30 
 
 
146 aa  40.4  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>