18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2155 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2155  copper resistance D  100 
 
 
164 aa  306  8e-83  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.976167  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2288  copper resistance D  37.86 
 
 
166 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.600323  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1734  hypothetical protein  33.03 
 
 
165 aa  58.2  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3627  hypothetical protein  33.64 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105374  normal  0.900637 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1279  protein of unknown function DUF474  30 
 
 
149 aa  51.2  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352216  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2795  hypothetical protein  31.37 
 
 
146 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4251  hypothetical protein  31.53 
 
 
145 aa  48.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615167  normal  0.215178 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3242  hypothetical protein  31.71 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.365102  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0447  protein of unknown function DUF474  24.58 
 
 
149 aa  47  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136192  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2633  copper resistance protein CopC  31.16 
 
 
613 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0620  hypothetical protein  34.21 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4061  hypothetical protein  27.78 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0696  hypothetical protein  32.04 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1652  copper resistance D domain-containing protein  25.49 
 
 
927 aa  42.4  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4272  copper resistance D  30.65 
 
 
310 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0975994 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0247  hypothetical protein  37.93 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5201  hypothetical protein  28.99 
 
 
156 aa  41.2  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.47253 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19440  hypothetical protein  32.88 
 
 
154 aa  40.8  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>