17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_5201 on replicon NC_009507
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009507  Swit_5201  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  302  1.0000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.47253 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3043  hypothetical protein  67.32 
 
 		 160 aa  207  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3172  hypothetical protein  73.03 
 
 		 153 aa  201  3e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.972576 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1688  hypothetical protein  73.2 
 
 		 154 aa  196  9e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.129922  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2076  hypothetical protein  52.29 
 
 		 160 aa  159  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0925845  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1007  hypothetical protein  51.61 
 
 		 158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.198465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1035  hypothetical protein  43.79 
 
 		 160 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251196  normal  0.343777 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3213  hypothetical protein  47.06 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00312198 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2418  hypothetical protein  47.06 
 
 		 159 aa  131  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0147381  normal  0.0370293 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2813  hypothetical protein  48.39 
 
 		 158 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2357  hypothetical protein  46.71 
 
 		 156 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2236  hypothetical protein  43.71 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1482  hypothetical protein  40.91 
 
 		 153 aa  121  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.363351  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1714  hypothetical protein  35 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2085  hypothetical protein  28.46 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0355762  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1629  hypothetical protein  28.46 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.718738 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0964  hypothetical protein  26.71 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26934  normal  0.144161 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>