20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3627 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3627  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  288  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105374  normal  0.900637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4251  hypothetical protein  62.04 
 
 
145 aa  164  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615167  normal  0.215178 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2795  hypothetical protein  60.71 
 
 
146 aa  160  5.0000000000000005e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3242  hypothetical protein  51.09 
 
 
145 aa  147  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.365102  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0502  hypothetical protein  49.65 
 
 
145 aa  124  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.24703 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0447  protein of unknown function DUF474  30.99 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000136192  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2155  copper resistance D  33.64 
 
 
164 aa  53.5  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.976167  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1279  protein of unknown function DUF474  28.33 
 
 
149 aa  50.8  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000352216  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3172  hypothetical protein  33.73 
 
 
153 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.972576 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3213  hypothetical protein  42 
 
 
158 aa  45.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00312198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3235  hypothetical protein  36.21 
 
 
133 aa  45.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.980786  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2288  copper resistance D  27.89 
 
 
166 aa  44.7  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.600323  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2694  hypothetical protein  37.08 
 
 
166 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1035  hypothetical protein  21.48 
 
 
160 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251196  normal  0.343777 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0946  copper resistance protein CopC  39.44 
 
 
697 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.116964  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4061  hypothetical protein  31.51 
 
 
148 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1734  hypothetical protein  29.13 
 
 
165 aa  41.2  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.506892 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2418  hypothetical protein  27.73 
 
 
159 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0147381  normal  0.0370293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2357  hypothetical protein  32.58 
 
 
156 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  32.22 
 
 
578 aa  40.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>