22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3213 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3213  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  308  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00312198 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2813  hypothetical protein  58.86 
 
 		 158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2418  hypothetical protein  57.59 
 
 		 159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0147381  normal  0.0370293 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2076  hypothetical protein  50.32 
 
 		 160 aa  154  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0925845  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1007  hypothetical protein  53.16 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.198465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2357  hypothetical protein  50.34 
 
 		 156 aa  150  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3043  hypothetical protein  48.05 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5201  hypothetical protein  47.06 
 
 		 156 aa  136  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.47253 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1035  hypothetical protein  43.33 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251196  normal  0.343777 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2236  hypothetical protein  45.39 
 
 		 159 aa  127  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3172  hypothetical protein  48.53 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.972576 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1688  hypothetical protein  47.52 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.129922  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1482  hypothetical protein  41.29 
 
 		 153 aa  103  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.363351  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3386  hypothetical protein  29.14 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1714  hypothetical protein  32.71 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3627  hypothetical protein  42 
 
 		 149 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105374  normal  0.900637 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0764  hypothetical protein  40.91 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.503732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1219  hypothetical protein  32.86 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1341  hypothetical protein  26 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1332  hypothetical protein  28.3 
 
 		 181 aa  42  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2085  hypothetical protein  30.1 
 
 		 159 aa  41.2  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0355762  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1629  hypothetical protein  30.1 
 
 		 159 aa  40.8  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.718738 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>