15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2813 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_2813  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  308  2e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2418  hypothetical protein  89.24 
 
 
159 aa  281  3.0000000000000004e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0147381  normal  0.0370293 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3213  hypothetical protein  58.86 
 
 
158 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00312198 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2076  hypothetical protein  52.26 
 
 
160 aa  159  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0925845  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1007  hypothetical protein  53.16 
 
 
158 aa  151  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.198465  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5201  hypothetical protein  48.39 
 
 
156 aa  131  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.47253 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1035  hypothetical protein  43.42 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251196  normal  0.343777 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3043  hypothetical protein  45.16 
 
 
160 aa  123  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3172  hypothetical protein  52.94 
 
 
153 aa  123  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.972576 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2357  hypothetical protein  45.64 
 
 
156 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2236  hypothetical protein  43.42 
 
 
159 aa  114  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1482  hypothetical protein  44.87 
 
 
153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.363351  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1688  hypothetical protein  44.81 
 
 
154 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.129922  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1235  hypothetical protein  29.1 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0942  hypothetical protein  35.29 
 
 
152 aa  42  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>