16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1688 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1688  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  297  3e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.129922  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5201  hypothetical protein  73.2 
 
 		 156 aa  226  6e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.47253 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3043  hypothetical protein  60.39 
 
 		 160 aa  187  5e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3172  hypothetical protein  63.82 
 
 		 153 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.972576 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2076  hypothetical protein  53.9 
 
 		 160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0925845  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1007  hypothetical protein  50.64 
 
 		 158 aa  145  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.198465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1035  hypothetical protein  43.14 
 
 		 160 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251196  normal  0.343777 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3213  hypothetical protein  47.4 
 
 		 158 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00312198 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2357  hypothetical protein  46.98 
 
 		 156 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2236  hypothetical protein  46.98 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2418  hypothetical protein  44.16 
 
 		 159 aa  118  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0147381  normal  0.0370293 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2813  hypothetical protein  44.81 
 
 		 158 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1482  hypothetical protein  40.38 
 
 		 153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.363351  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1714  hypothetical protein  46.27 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0019  hypothetical protein  31.68 
 
 		 153 aa  46.2  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1219  hypothetical protein  31.34 
 
 		 158 aa  40.4  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>