56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1714 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1714  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  303  8.000000000000001e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1219  hypothetical protein  70.29 
 
 		 158 aa  197  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2085  hypothetical protein  55.84 
 
 		 159 aa  165  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0355762  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1629  hypothetical protein  55.19 
 
 		 159 aa  163  9e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.718738 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2880  hypothetical protein  40.69 
 
 		 153 aa  102  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1207  hypothetical protein  41.78 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3337  hypothetical protein  41.78 
 
 		 152 aa  97.4  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.157074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0921  integral membrane protein-like protein  43.66 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447936  normal  0.0580845 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0800  hypothetical protein  43.84 
 
 		 151 aa  92.8  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0942  hypothetical protein  41.55 
 
 		 152 aa  91.7  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1149  hypothetical protein  41.13 
 
 		 152 aa  90.9  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2530  hypothetical protein  40.43 
 
 		 152 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2276  integral membrane protein-like protein  41.26 
 
 		 152 aa  90.5  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1302  integral membrane protein  40.43 
 
 		 152 aa  90.9  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0696  hypothetical protein  40.43 
 
 		 152 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2084  hypothetical protein  40.43 
 
 		 152 aa  90.5  7e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0121  hypothetical protein  42.04 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1160  hypothetical protein  43.51 
 
 		 154 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.812737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1141  hypothetical protein  40.43 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.571373  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1124  hypothetical protein  42.86 
 
 		 154 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.870352  hitchhiker  0.0000463461 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4291  hypothetical protein  42.86 
 
 		 154 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0247  hypothetical protein  41.1 
 
 		 147 aa  87.4  7e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2358  integral membrane protein-like protein  43.7 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2379  integral membrane protein-like protein  43.7 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1746  integral membrane protein-like  43.7 
 
 		 152 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2122  hypothetical protein  42.06 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237479  normal  0.0928578 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19440  hypothetical protein  36.3 
 
 		 154 aa  84.7  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5697  integral membrane protein-like  42.15 
 
 		 152 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900731  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0527  hypothetical protein  40 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2394  integral membrane protein-like protein  42.98 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1145  hypothetical protein  43.51 
 
 		 154 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.827755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4335  hypothetical protein  42.86 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000550013  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4121  hypothetical protein  40.69 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.817683  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3857  hypothetical protein  37.01 
 
 		 154 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.693572  normal  0.621208 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1426  integral membrane protein-like protein  39.61 
 
 		 154 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0942563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1610  hypothetical protein  38.24 
 
 		 155 aa  77.4  0.00000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.593117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0964  hypothetical protein  38.03 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26934  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3552  conserved hypothetical membrane spanning protein  43.48 
 
 		 153 aa  77  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.137543  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2211  hypothetical protein  39.53 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1224  hypothetical protein  37.01 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0319  hypothetical protein  36.88 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.361772  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0019  hypothetical protein  39.44 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2220  integral membrane protein  39.84 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50850  hypothetical protein  38.57 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000932662 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0149  hypothetical protein  31.29 
 
 		 160 aa  65.5  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1065  hypothetical protein  31.97 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0949  hypothetical protein  31.97 
 
 		 154 aa  65.5  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2208  hypothetical protein  34.04 
 
 		 150 aa  62  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3321  putative integral membrane protein  30.14 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.21212 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2159  hypothetical protein  29.46 
 
 		 133 aa  48.9  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552957 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3043  hypothetical protein  32.43 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3213  hypothetical protein  32.2 
 
 		 158 aa  46.2  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00312198 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5201  hypothetical protein  35 
 
 		 156 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.47253 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1035  hypothetical protein  41.27 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251196  normal  0.343777 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2357  hypothetical protein  40.91 
 
 		 156 aa  42.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3172  hypothetical protein  34.91 
 
 		 153 aa  42.4  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.972576 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>