51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3857 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3857  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  299  7.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.693572  normal  0.621208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4121  hypothetical protein  91.45 
 
 		 154 aa  262  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.817683  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19440  hypothetical protein  65.79 
 
 		 154 aa  211  2.9999999999999995e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1224  hypothetical protein  65.79 
 
 		 154 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1124  hypothetical protein  66.23 
 
 		 154 aa  207  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.870352  hitchhiker  0.0000463461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1160  hypothetical protein  66.23 
 
 		 154 aa  207  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.812737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4291  hypothetical protein  66.23 
 
 		 154 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1145  hypothetical protein  68.87 
 
 		 154 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.827755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4335  hypothetical protein  66.23 
 
 		 154 aa  201  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000550013  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50850  hypothetical protein  66.88 
 
 		 154 aa  187  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000932662 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1426  integral membrane protein-like protein  61.18 
 
 		 154 aa  179  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0942563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2880  hypothetical protein  47.95 
 
 		 153 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0800  hypothetical protein  47.06 
 
 		 151 aa  116  9e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0019  hypothetical protein  47.18 
 
 		 153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0964  hypothetical protein  40 
 
 		 152 aa  107  8.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26934  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0527  hypothetical protein  44.67 
 
 		 155 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3337  hypothetical protein  46.21 
 
 		 152 aa  102  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.157074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1207  hypothetical protein  45.52 
 
 		 152 aa  101  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0121  hypothetical protein  42.96 
 
 		 152 aa  95.1  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1610  hypothetical protein  41.1 
 
 		 155 aa  94.4  6e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.593117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2208  hypothetical protein  40.62 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2220  integral membrane protein  45.64 
 
 		 153 aa  87  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1141  hypothetical protein  40.56 
 
 		 152 aa  87  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.571373  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0921  integral membrane protein-like protein  41.89 
 
 		 152 aa  87  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447936  normal  0.0580845 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0696  hypothetical protein  40.56 
 
 		 152 aa  87  9e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2530  hypothetical protein  40.56 
 
 		 152 aa  87  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2084  hypothetical protein  40.56 
 
 		 152 aa  87  9e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1302  integral membrane protein  40.56 
 
 		 152 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1149  hypothetical protein  40.56 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2276  integral membrane protein-like protein  42.55 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0942  hypothetical protein  39.86 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0149  hypothetical protein  35.17 
 
 		 160 aa  84.7  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3552  conserved hypothetical membrane spanning protein  41.13 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.137543  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1629  hypothetical protein  37.41 
 
 		 159 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.718738 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2085  hypothetical protein  37.41 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0355762  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2122  hypothetical protein  39.31 
 
 		 152 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237479  normal  0.0928578 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5697  integral membrane protein-like  40.94 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900731  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1746  integral membrane protein-like  43.22 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2358  integral membrane protein-like protein  43.22 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2379  integral membrane protein-like protein  43.22 
 
 		 152 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1714  hypothetical protein  37.86 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2394  integral membrane protein-like protein  41.67 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2159  hypothetical protein  36.43 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552957 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1065  hypothetical protein  34.67 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0949  hypothetical protein  34.67 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2211  hypothetical protein  38.4 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0247  hypothetical protein  36.99 
 
 		 147 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3321  putative integral membrane protein  34.67 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.21212 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1219  hypothetical protein  35.07 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0319  hypothetical protein  34.33 
 
 		 160 aa  60.5  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.361772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0696  hypothetical protein  35.21 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>