52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1610 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_1610  hypothetical protein  100 
 
 
155 aa  300  4.0000000000000003e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.593117  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2880  hypothetical protein  49.33 
 
 
153 aa  156  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0527  hypothetical protein  51.82 
 
 
155 aa  141  3e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0800  hypothetical protein  51.37 
 
 
151 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0019  hypothetical protein  51.7 
 
 
153 aa  137  6e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0964  hypothetical protein  41.33 
 
 
152 aa  121  5e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26934  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0149  hypothetical protein  44.22 
 
 
160 aa  110  6e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19440  hypothetical protein  44 
 
 
154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3857  hypothetical protein  41.1 
 
 
154 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.693572  normal  0.621208 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4335  hypothetical protein  46.32 
 
 
154 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000550013  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4121  hypothetical protein  43.8 
 
 
154 aa  104  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.817683  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1224  hypothetical protein  41.78 
 
 
154 aa  102  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1160  hypothetical protein  42.67 
 
 
154 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.812737  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2159  hypothetical protein  43.61 
 
 
133 aa  102  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.552957 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1124  hypothetical protein  42 
 
 
154 aa  100  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.870352  hitchhiker  0.0000463461 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1426  integral membrane protein-like protein  46.1 
 
 
154 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0942563  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1207  hypothetical protein  44.3 
 
 
152 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760838  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3337  hypothetical protein  43.62 
 
 
152 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.157074  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4291  hypothetical protein  41.33 
 
 
154 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3552  conserved hypothetical membrane spanning protein  46.27 
 
 
153 aa  98.6  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.137543  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2208  hypothetical protein  43.75 
 
 
150 aa  96.7  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50850  hypothetical protein  46.32 
 
 
154 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000932662 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1145  hypothetical protein  42 
 
 
154 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.827755 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2220  integral membrane protein  43.42 
 
 
153 aa  91.3  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2276  integral membrane protein-like protein  43.66 
 
 
152 aa  89.7  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1629  hypothetical protein  41.3 
 
 
159 aa  89.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.718738 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2085  hypothetical protein  41.3 
 
 
159 aa  90.1  1e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0355762  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2122  hypothetical protein  42.95 
 
 
152 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237479  normal  0.0928578 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0942  hypothetical protein  42.96 
 
 
152 aa  88.2  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0921  integral membrane protein-like protein  42.96 
 
 
152 aa  87.8  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447936  normal  0.0580845 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1302  integral membrane protein  42.25 
 
 
152 aa  87.8  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2084  hypothetical protein  41.55 
 
 
152 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1141  hypothetical protein  41.55 
 
 
152 aa  85.9  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.571373  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2530  hypothetical protein  41.55 
 
 
152 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0696  hypothetical protein  41.55 
 
 
152 aa  85.9  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1149  hypothetical protein  41.55 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3321  putative integral membrane protein  33.78 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.21212 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1714  hypothetical protein  38.81 
 
 
158 aa  79.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0121  hypothetical protein  37.06 
 
 
152 aa  79  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5697  integral membrane protein-like  44.44 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900731  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0247  hypothetical protein  40.15 
 
 
147 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2394  integral membrane protein-like protein  43.65 
 
 
152 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1746  integral membrane protein-like  43.44 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2379  integral membrane protein-like protein  43.44 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2358  integral membrane protein-like protein  43.44 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0319  hypothetical protein  38.28 
 
 
160 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.361772  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1065  hypothetical protein  34.03 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0949  hypothetical protein  34.03 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2211  hypothetical protein  39.52 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1219  hypothetical protein  34.88 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1035  hypothetical protein  28.12 
 
 
160 aa  47  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251196  normal  0.343777 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2076  hypothetical protein  26.21 
 
 
160 aa  41.2  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0925845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>