55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A5697 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A5697  integral membrane protein-like  100 
 
 
152 aa  293  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900731  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2276  integral membrane protein-like protein  95.39 
 
 
152 aa  283  8e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0942  hypothetical protein  91.45 
 
 
152 aa  276  6e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0921  integral membrane protein-like protein  92.76 
 
 
152 aa  275  1e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447936  normal  0.0580845 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1149  hypothetical protein  90.79 
 
 
152 aa  275  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1302  integral membrane protein  90.79 
 
 
152 aa  275  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0696  hypothetical protein  90.79 
 
 
152 aa  274  3e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2084  hypothetical protein  90.79 
 
 
152 aa  274  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2530  hypothetical protein  90.79 
 
 
152 aa  274  3e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1141  hypothetical protein  89.47 
 
 
152 aa  270  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.571373  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2394  integral membrane protein-like protein  96.05 
 
 
152 aa  258  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1207  hypothetical protein  83.55 
 
 
152 aa  256  7e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760838  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3337  hypothetical protein  82.24 
 
 
152 aa  253  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.157074  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2379  integral membrane protein-like protein  94.74 
 
 
152 aa  253  7e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2358  integral membrane protein-like protein  94.74 
 
 
152 aa  253  7e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1746  integral membrane protein-like  94.74 
 
 
152 aa  253  7e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2211  hypothetical protein  90.77 
 
 
130 aa  237  4e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2122  hypothetical protein  80.92 
 
 
152 aa  233  5.0000000000000005e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237479  normal  0.0928578 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0800  hypothetical protein  49.32 
 
 
151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2880  hypothetical protein  44.83 
 
 
153 aa  121  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0121  hypothetical protein  42.07 
 
 
152 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2085  hypothetical protein  43.88 
 
 
159 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0355762  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1629  hypothetical protein  43.88 
 
 
159 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.718738 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0247  hypothetical protein  44.85 
 
 
147 aa  99.4  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1219  hypothetical protein  45.38 
 
 
158 aa  96.7  9e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0527  hypothetical protein  45.71 
 
 
155 aa  95.5  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0019  hypothetical protein  41.89 
 
 
153 aa  94.7  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19440  hypothetical protein  42.47 
 
 
154 aa  92.8  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1124  hypothetical protein  43.88 
 
 
154 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.870352  hitchhiker  0.0000463461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1160  hypothetical protein  43.88 
 
 
154 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.812737  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2220  integral membrane protein  46.26 
 
 
153 aa  89  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3857  hypothetical protein  41.89 
 
 
154 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.693572  normal  0.621208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4121  hypothetical protein  43.17 
 
 
154 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.817683  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2208  hypothetical protein  40.16 
 
 
150 aa  88.2  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3321  putative integral membrane protein  35.06 
 
 
150 aa  87.4  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.21212 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1714  hypothetical protein  40 
 
 
158 aa  87.4  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4291  hypothetical protein  41.73 
 
 
154 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1610  hypothetical protein  43.75 
 
 
155 aa  81.3  0.000000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.593117  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1224  hypothetical protein  41.01 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4335  hypothetical protein  42.97 
 
 
154 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000550013  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0319  hypothetical protein  40.16 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.361772  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50850  hypothetical protein  44.53 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000932662 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1145  hypothetical protein  42.45 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.827755 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0964  hypothetical protein  36.81 
 
 
152 aa  72.4  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26934  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2159  hypothetical protein  36.89 
 
 
133 aa  70.5  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.552957 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0149  hypothetical protein  32.45 
 
 
160 aa  69.7  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3552  conserved hypothetical membrane spanning protein  40.31 
 
 
153 aa  69.7  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.137543  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1426  integral membrane protein-like protein  41.35 
 
 
154 aa  67  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0942563  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1065  hypothetical protein  32.43 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0949  hypothetical protein  32.43 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2357  hypothetical protein  26.76 
 
 
156 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0696  hypothetical protein  33.68 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2418  hypothetical protein  36.42 
 
 
159 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0147381  normal  0.0370293 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1007  hypothetical protein  30.13 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.198465  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1035  hypothetical protein  26.42 
 
 
160 aa  40.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251196  normal  0.343777 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>