36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2357 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2357  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  305  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1007  hypothetical protein  51.92 
 
 		 158 aa  153  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.198465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2076  hypothetical protein  50.34 
 
 		 160 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0925845  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3213  hypothetical protein  50.34 
 
 		 158 aa  150  8e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00312198 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1035  hypothetical protein  45.1 
 
 		 160 aa  134  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251196  normal  0.343777 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5201  hypothetical protein  46.71 
 
 		 156 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.47253 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2236  hypothetical protein  45.58 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3043  hypothetical protein  44.3 
 
 		 160 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2418  hypothetical protein  46.31 
 
 		 159 aa  117  7.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0147381  normal  0.0370293 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2813  hypothetical protein  45.64 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3172  hypothetical protein  47.68 
 
 		 153 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.972576 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1688  hypothetical protein  46.98 
 
 		 154 aa  101  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.129922  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1482  hypothetical protein  43.15 
 
 		 153 aa  100  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.363351  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2122  hypothetical protein  31.52 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237479  normal  0.0928578 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2394  integral membrane protein-like protein  30.43 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2276  integral membrane protein-like protein  27.97 
 
 		 152 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1219  hypothetical protein  32.67 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5697  integral membrane protein-like  29.35 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900731  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1746  integral membrane protein-like  28.26 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2358  integral membrane protein-like protein  28.26 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1207  hypothetical protein  30 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2379  integral membrane protein-like protein  28.26 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0921  integral membrane protein-like protein  27.03 
 
 		 152 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447936  normal  0.0580845 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1149  hypothetical protein  27.17 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0942  hypothetical protein  28.26 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2084  hypothetical protein  27.17 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1141  hypothetical protein  27.17 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.571373  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2530  hypothetical protein  27.17 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1714  hypothetical protein  40.91 
 
 		 158 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0696  hypothetical protein  27.17 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1629  hypothetical protein  29.35 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.718738 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0247  hypothetical protein  34.69 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3337  hypothetical protein  29.09 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.157074  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2085  hypothetical protein  29.35 
 
 		 159 aa  42.4  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0355762  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1302  integral membrane protein  35.16 
 
 		 152 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3627  hypothetical protein  32.58 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.105374  normal  0.900637 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>