57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_2358 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2379  integral membrane protein-like protein  100 
 
 		 152 aa  290  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2358  integral membrane protein-like protein  100 
 
 		 152 aa  290  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1746  integral membrane protein-like  100 
 
 		 152 aa  290  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2276  integral membrane protein-like protein  95.39 
 
 		 152 aa  281  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0921  integral membrane protein-like protein  94.08 
 
 		 152 aa  277  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447936  normal  0.0580845 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1149  hypothetical protein  92.76 
 
 		 152 aa  276  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1302  integral membrane protein  92.11 
 
 		 152 aa  273  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0942  hypothetical protein  91.45 
 
 		 152 aa  274  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0696  hypothetical protein  92.11 
 
 		 152 aa  273  5e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2530  hypothetical protein  92.11 
 
 		 152 aa  273  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2084  hypothetical protein  92.11 
 
 		 152 aa  273  5e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1141  hypothetical protein  91.45 
 
 		 152 aa  272  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.571373  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2394  integral membrane protein-like protein  95.39 
 
 		 152 aa  254  4e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5697  integral membrane protein-like  94.74 
 
 		 152 aa  253  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900731  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1207  hypothetical protein  80.92 
 
 		 152 aa  248  2e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3337  hypothetical protein  80.92 
 
 		 152 aa  248  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.157074  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2211  hypothetical protein  91.54 
 
 		 130 aa  236  5.999999999999999e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2122  hypothetical protein  79.61 
 
 		 152 aa  227  4e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237479  normal  0.0928578 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0800  hypothetical protein  47.95 
 
 		 151 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2880  hypothetical protein  44.83 
 
 		 153 aa  123  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2085  hypothetical protein  45.32 
 
 		 159 aa  106  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0355762  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1629  hypothetical protein  45.32 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.718738 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0121  hypothetical protein  43.45 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0247  hypothetical protein  46.32 
 
 		 147 aa  103  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0019  hypothetical protein  42.67 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0527  hypothetical protein  45 
 
 		 155 aa  96.7  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1219  hypothetical protein  44.62 
 
 		 158 aa  96.7  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19440  hypothetical protein  43.97 
 
 		 154 aa  92.8  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1124  hypothetical protein  43.15 
 
 		 154 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.870352  hitchhiker  0.0000463461 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2220  integral membrane protein  46.94 
 
 		 153 aa  90.5  7e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1714  hypothetical protein  41.35 
 
 		 158 aa  90.5  8e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1160  hypothetical protein  43.15 
 
 		 154 aa  90.1  9e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.812737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2208  hypothetical protein  40.94 
 
 		 150 aa  90.1  9e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3857  hypothetical protein  43.26 
 
 		 154 aa  87  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.693572  normal  0.621208 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4121  hypothetical protein  44.7 
 
 		 154 aa  87  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.817683  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4291  hypothetical protein  41.1 
 
 		 154 aa  85.5  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0319  hypothetical protein  41.22 
 
 		 160 aa  84  7e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.361772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4335  hypothetical protein  44.53 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000550013  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1224  hypothetical protein  41.73 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3321  putative integral membrane protein  34.42 
 
 		 150 aa  82.4  0.000000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.21212 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50850  hypothetical protein  46.09 
 
 		 154 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000932662 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1610  hypothetical protein  42.19 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.593117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1145  hypothetical protein  41.78 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.827755 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0149  hypothetical protein  34.44 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0964  hypothetical protein  35.42 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26934  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1426  integral membrane protein-like protein  43.61 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0942563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3552  conserved hypothetical membrane spanning protein  41.09 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.137543  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2159  hypothetical protein  35.54 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552957 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0949  hypothetical protein  33.11 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1065  hypothetical protein  33.11 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2357  hypothetical protein  26.57 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1007  hypothetical protein  30.38 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.198465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0696  hypothetical protein  32.63 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1897  hypothetical protein  28.57 
 
 		 160 aa  42  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.400946  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  35.05 
 
 		 549 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  32.99 
 
 		 547 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1035  hypothetical protein  26.85 
 
 		 160 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251196  normal  0.343777 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>