52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0121 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0121  hypothetical protein  100 
 
 		 152 aa  288  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3337  hypothetical protein  46.21 
 
 		 152 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.157074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1207  hypothetical protein  45.52 
 
 		 152 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0942  hypothetical protein  44.83 
 
 		 152 aa  107  8.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1141  hypothetical protein  45.14 
 
 		 152 aa  106  9.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.571373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2084  hypothetical protein  44.83 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1302  integral membrane protein  44.83 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2530  hypothetical protein  44.83 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0696  hypothetical protein  44.83 
 
 		 152 aa  106  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1149  hypothetical protein  44.83 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0800  hypothetical protein  41.38 
 
 		 151 aa  103  8e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2276  integral membrane protein-like protein  42.07 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0921  integral membrane protein-like protein  42.76 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447936  normal  0.0580845 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0019  hypothetical protein  43.28 
 
 		 153 aa  98.6  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3857  hypothetical protein  42.96 
 
 		 154 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.693572  normal  0.621208 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2880  hypothetical protein  38.13 
 
 		 153 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4121  hypothetical protein  41.67 
 
 		 154 aa  91.3  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.817683  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2122  hypothetical protein  42.76 
 
 		 152 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237479  normal  0.0928578 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4335  hypothetical protein  42.22 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000550013  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1124  hypothetical protein  38.78 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.870352  hitchhiker  0.0000463461 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19440  hypothetical protein  37.24 
 
 		 154 aa  88.6  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1160  hypothetical protein  38.78 
 
 		 154 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.812737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4291  hypothetical protein  38.78 
 
 		 154 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1746  integral membrane protein-like  43.45 
 
 		 152 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2379  integral membrane protein-like protein  43.45 
 
 		 152 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2358  integral membrane protein-like protein  43.45 
 
 		 152 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5697  integral membrane protein-like  42.07 
 
 		 152 aa  85.1  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900731  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2211  hypothetical protein  41.73 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2394  integral membrane protein-like protein  42.07 
 
 		 152 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1145  hypothetical protein  38.78 
 
 		 154 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.827755 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1224  hypothetical protein  38.36 
 
 		 154 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1714  hypothetical protein  41.78 
 
 		 158 aa  81.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2085  hypothetical protein  38.51 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0355762  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1629  hypothetical protein  38.51 
 
 		 159 aa  81.6  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.718738 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1426  integral membrane protein-like protein  40.14 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0942563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50850  hypothetical protein  40.74 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000932662 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1610  hypothetical protein  36.3 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.593117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3321  putative integral membrane protein  34.31 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.21212 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2220  integral membrane protein  38.36 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0319  hypothetical protein  32.37 
 
 		 160 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.361772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3552  conserved hypothetical membrane spanning protein  36.51 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.137543  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0247  hypothetical protein  35.66 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1219  hypothetical protein  34.75 
 
 		 158 aa  65.1  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2159  hypothetical protein  36.75 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552957 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0527  hypothetical protein  33.82 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0964  hypothetical protein  32.61 
 
 		 152 aa  57  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26934  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2208  hypothetical protein  29.13 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1897  hypothetical protein  26.76 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.400946  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0949  hypothetical protein  29.71 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1065  hypothetical protein  29.71 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1666  hypothetical protein  25.16 
 
 		 165 aa  40.8  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.149845  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  36.27 
 
 		 578 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>