50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4121 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4121  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  298  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.817683  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3857  hypothetical protein  91.45 
 
 		 154 aa  275  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.693572  normal  0.621208 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19440  hypothetical protein  66.88 
 
 		 154 aa  215  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1224  hypothetical protein  66.67 
 
 		 154 aa  209  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1124  hypothetical protein  66.67 
 
 		 154 aa  205  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.870352  hitchhiker  0.0000463461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1160  hypothetical protein  66.67 
 
 		 154 aa  205  2e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.812737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4291  hypothetical protein  66.89 
 
 		 154 aa  204  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1145  hypothetical protein  69.54 
 
 		 154 aa  201  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.827755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4335  hypothetical protein  67.11 
 
 		 154 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000550013  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50850  hypothetical protein  67.76 
 
 		 154 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000932662 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1426  integral membrane protein-like protein  60.39 
 
 		 154 aa  179  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0942563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2880  hypothetical protein  50.68 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0800  hypothetical protein  47.45 
 
 		 151 aa  116  9e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0019  hypothetical protein  47.52 
 
 		 153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0964  hypothetical protein  41.89 
 
 		 152 aa  107  8.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26934  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0527  hypothetical protein  44.67 
 
 		 155 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3337  hypothetical protein  47.86 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.157074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1207  hypothetical protein  47.14 
 
 		 152 aa  101  5e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1610  hypothetical protein  43.84 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.593117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0121  hypothetical protein  41.73 
 
 		 152 aa  94  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2220  integral membrane protein  45.64 
 
 		 153 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2208  hypothetical protein  38.89 
 
 		 150 aa  87.8  4e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0696  hypothetical protein  43.17 
 
 		 152 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2530  hypothetical protein  43.17 
 
 		 152 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1141  hypothetical protein  43.17 
 
 		 152 aa  88.2  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.571373  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2084  hypothetical protein  43.17 
 
 		 152 aa  87.8  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1302  integral membrane protein  43.17 
 
 		 152 aa  87.8  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3552  conserved hypothetical membrane spanning protein  41.73 
 
 		 153 aa  87.4  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.137543  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0921  integral membrane protein-like protein  43.17 
 
 		 152 aa  87  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447936  normal  0.0580845 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1149  hypothetical protein  43.17 
 
 		 152 aa  87  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0942  hypothetical protein  42.45 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2276  integral membrane protein-like protein  42.45 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0149  hypothetical protein  35.17 
 
 		 160 aa  82.8  0.000000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2085  hypothetical protein  38.1 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0355762  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1629  hypothetical protein  38.1 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.718738 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2122  hypothetical protein  40.71 
 
 		 152 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237479  normal  0.0928578 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5697  integral membrane protein-like  43.2 
 
 		 152 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900731  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1714  hypothetical protein  40.43 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1746  integral membrane protein-like  44.92 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2379  integral membrane protein-like protein  44.92 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2358  integral membrane protein-like protein  44.92 
 
 		 152 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2394  integral membrane protein-like protein  44.07 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0247  hypothetical protein  40.41 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2159  hypothetical protein  36.43 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.552957 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2211  hypothetical protein  40.62 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0949  hypothetical protein  34.53 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1065  hypothetical protein  34.53 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1219  hypothetical protein  35.07 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0319  hypothetical protein  34.33 
 
 		 160 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.361772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3321  putative integral membrane protein  35.81 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.21212 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>