51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_19440 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_19440  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  298  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3857  hypothetical protein  65.79 
 
 
154 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.693572  normal  0.621208 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1224  hypothetical protein  64.05 
 
 
154 aa  206  8e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4335  hypothetical protein  72.37 
 
 
154 aa  202  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000550013  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4121  hypothetical protein  66.88 
 
 
154 aa  202  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.817683  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1160  hypothetical protein  63.58 
 
 
154 aa  201  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.812737  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1124  hypothetical protein  62.91 
 
 
154 aa  199  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.870352  hitchhiker  0.0000463461 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4291  hypothetical protein  61.59 
 
 
154 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1145  hypothetical protein  63.58 
 
 
154 aa  189  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.827755 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50850  hypothetical protein  69.74 
 
 
154 aa  186  9e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000932662 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1426  integral membrane protein-like protein  62.99 
 
 
154 aa  174  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0942563  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2880  hypothetical protein  51.37 
 
 
153 aa  148  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0800  hypothetical protein  48.57 
 
 
151 aa  118  3e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0019  hypothetical protein  46.21 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0527  hypothetical protein  44 
 
 
155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0964  hypothetical protein  42.57 
 
 
152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26934  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3337  hypothetical protein  44.44 
 
 
152 aa  105  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.157074  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1207  hypothetical protein  43.75 
 
 
152 aa  104  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760838  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1610  hypothetical protein  45.11 
 
 
155 aa  101  4e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.593117  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2220  integral membrane protein  47.97 
 
 
153 aa  100  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0696  hypothetical protein  43.97 
 
 
152 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2084  hypothetical protein  43.97 
 
 
152 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2530  hypothetical protein  43.97 
 
 
152 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1141  hypothetical protein  43.97 
 
 
152 aa  94.4  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.571373  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1149  hypothetical protein  42.86 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1302  integral membrane protein  42.45 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0921  integral membrane protein-like protein  43.97 
 
 
152 aa  92  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447936  normal  0.0580845 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0942  hypothetical protein  43.26 
 
 
152 aa  91.3  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2276  integral membrane protein-like protein  43.26 
 
 
152 aa  91.7  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0149  hypothetical protein  39.31 
 
 
160 aa  90.1  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3552  conserved hypothetical membrane spanning protein  46.46 
 
 
153 aa  89.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.137543  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2208  hypothetical protein  39.86 
 
 
150 aa  89.4  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0121  hypothetical protein  37.24 
 
 
152 aa  88.6  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2122  hypothetical protein  41.43 
 
 
152 aa  84  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237479  normal  0.0928578 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1629  hypothetical protein  36.99 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.718738 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2085  hypothetical protein  36.99 
 
 
159 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0355762  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1746  integral membrane protein-like  42.37 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5697  integral membrane protein-like  40.65 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900731  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2379  integral membrane protein-like protein  42.37 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1714  hypothetical protein  35.46 
 
 
158 aa  80.9  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2358  integral membrane protein-like protein  42.37 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0247  hypothetical protein  39.07 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2394  integral membrane protein-like protein  41.53 
 
 
152 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2211  hypothetical protein  42.64 
 
 
130 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2159  hypothetical protein  37.98 
 
 
133 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.552957 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1219  hypothetical protein  35.56 
 
 
158 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0319  hypothetical protein  34.51 
 
 
160 aa  70.5  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.361772  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0949  hypothetical protein  29.37 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1065  hypothetical protein  29.37 
 
 
154 aa  64.7  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3321  putative integral membrane protein  34.67 
 
 
150 aa  57  0.00000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.21212 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0696  hypothetical protein  36.84 
 
 
160 aa  43.9  0.0009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>