57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10229_A2530 on replicon NC_008836
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10229



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A0696  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  293  5e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2530  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  293  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2084  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  293  5e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1141  hypothetical protein  98.68 
 
 
152 aa  289  8e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.571373  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1149  hypothetical protein  98.68 
 
 
152 aa  289  9e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1302  integral membrane protein  98.68 
 
 
152 aa  289  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0942  hypothetical protein  96.71 
 
 
152 aa  285  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2276  integral membrane protein-like protein  92.11 
 
 
152 aa  276  9e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0921  integral membrane protein-like protein  91.45 
 
 
152 aa  274  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447936  normal  0.0580845 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2211  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  254  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1207  hypothetical protein  82.24 
 
 
152 aa  252  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760838  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3337  hypothetical protein  82.24 
 
 
152 aa  251  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.157074  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2358  integral membrane protein-like protein  92.11 
 
 
152 aa  248  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2394  integral membrane protein-like protein  91.45 
 
 
152 aa  249  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1746  integral membrane protein-like  92.11 
 
 
152 aa  248  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2379  integral membrane protein-like protein  92.11 
 
 
152 aa  248  1e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5697  integral membrane protein-like  90.79 
 
 
152 aa  248  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900731  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2122  hypothetical protein  78.95 
 
 
152 aa  226  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237479  normal  0.0928578 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0800  hypothetical protein  48.63 
 
 
151 aa  125  3e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2880  hypothetical protein  46.21 
 
 
153 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0121  hypothetical protein  44.83 
 
 
152 aa  106  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.508764  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0019  hypothetical protein  44.67 
 
 
153 aa  103  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1219  hypothetical protein  46.15 
 
 
158 aa  100  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0247  hypothetical protein  45.59 
 
 
147 aa  99.8  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2085  hypothetical protein  44.2 
 
 
159 aa  99  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0355762  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1629  hypothetical protein  44.2 
 
 
159 aa  98.6  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.718738 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19440  hypothetical protein  43.97 
 
 
154 aa  94.4  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1124  hypothetical protein  42.47 
 
 
154 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.870352  hitchhiker  0.0000463461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1160  hypothetical protein  42.47 
 
 
154 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.812737  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0527  hypothetical protein  43.48 
 
 
155 aa  90.5  8e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2208  hypothetical protein  40.16 
 
 
150 aa  87.8  5e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3321  putative integral membrane protein  35.71 
 
 
150 aa  87  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.21212 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4121  hypothetical protein  43.17 
 
 
154 aa  87  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.817683  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3857  hypothetical protein  40.56 
 
 
154 aa  87  9e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.693572  normal  0.621208 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4291  hypothetical protein  40.41 
 
 
154 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1714  hypothetical protein  39.85 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2220  integral membrane protein  44.9 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1224  hypothetical protein  41.73 
 
 
154 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0319  hypothetical protein  38.93 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.361772  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1145  hypothetical protein  41.1 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.827755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4335  hypothetical protein  42.19 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.000550013  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50850  hypothetical protein  43.75 
 
 
154 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000932662 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1610  hypothetical protein  41.41 
 
 
155 aa  77  0.00000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.593117  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0149  hypothetical protein  34.75 
 
 
160 aa  70.9  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0964  hypothetical protein  33.79 
 
 
152 aa  70.1  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26934  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1065  hypothetical protein  36 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0949  hypothetical protein  36 
 
 
154 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3552  conserved hypothetical membrane spanning protein  40.31 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.137543  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2159  hypothetical protein  34.71 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.552957 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1426  integral membrane protein-like protein  40.6 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0942563  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1007  hypothetical protein  30.77 
 
 
158 aa  45.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.198465  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1897  hypothetical protein  23.84 
 
 
160 aa  43.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.400946  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2357  hypothetical protein  27.17 
 
 
156 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0696  hypothetical protein  33.33 
 
 
160 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1035  hypothetical protein  28.95 
 
 
160 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251196  normal  0.343777 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3426  hypothetical protein  40.3 
 
 
547 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.270494  hitchhiker  0.000000170591 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1917  hypothetical protein  41.79 
 
 
549 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0603122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>