30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1007 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1007  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  306  6.999999999999999e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.198465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1035  hypothetical protein  52.29 
 
 		 160 aa  174  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251196  normal  0.343777 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2076  hypothetical protein  52.6 
 
 		 160 aa  164  4e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0925845  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5201  hypothetical protein  51.61 
 
 		 156 aa  154  6e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.47253 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2357  hypothetical protein  51.92 
 
 		 156 aa  153  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3213  hypothetical protein  53.16 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00312198 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2813  hypothetical protein  53.16 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2418  hypothetical protein  52.53 
 
 		 159 aa  150  8e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0147381  normal  0.0370293 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2236  hypothetical protein  48.32 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3043  hypothetical protein  45.51 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3172  hypothetical protein  52.53 
 
 		 153 aa  130  7.999999999999999e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.972576 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1688  hypothetical protein  50.64 
 
 		 154 aa  127  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.129922  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1482  hypothetical protein  42.58 
 
 		 153 aa  108  3e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.363351  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1219  hypothetical protein  29.63 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0696  hypothetical protein  30.77 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2530  hypothetical protein  30.77 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2084  hypothetical protein  30.77 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.298343  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0800  hypothetical protein  30.72 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1149  hypothetical protein  31.01 
 
 		 152 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1302  integral membrane protein  30.77 
 
 		 152 aa  43.9  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0942  hypothetical protein  30.38 
 
 		 152 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1141  hypothetical protein  30.13 
 
 		 152 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.571373  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2276  integral membrane protein-like protein  30.77 
 
 		 152 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4251  hypothetical protein  30.36 
 
 		 145 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.615167  normal  0.215178 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2795  hypothetical protein  28.97 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1207  hypothetical protein  27.85 
 
 		 152 aa  41.6  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2358  integral membrane protein-like protein  31.82 
 
 		 152 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1746  integral membrane protein-like  31.82 
 
 		 152 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2379  integral membrane protein-like protein  31.82 
 
 		 152 aa  40.8  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5697  integral membrane protein-like  32.58 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.900731  normal  0.952882 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>