15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3043 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3043  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  313  7e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.156746 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5201  hypothetical protein  67.32 
 
 
156 aa  207  4e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.47253 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3172  hypothetical protein  61.84 
 
 
153 aa  166  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.972576 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1688  hypothetical protein  60.39 
 
 
154 aa  164  5e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.129922  normal  0.872356 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3213  hypothetical protein  48.05 
 
 
158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00312198 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2076  hypothetical protein  46.75 
 
 
160 aa  138  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0925845  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1007  hypothetical protein  45.51 
 
 
158 aa  135  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.198465  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1035  hypothetical protein  42.21 
 
 
160 aa  134  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.251196  normal  0.343777 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2418  hypothetical protein  47.74 
 
 
159 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0147381  normal  0.0370293 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2813  hypothetical protein  45.16 
 
 
158 aa  123  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2357  hypothetical protein  44.3 
 
 
156 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2236  hypothetical protein  40.4 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1482  hypothetical protein  42.21 
 
 
153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.363351  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1714  hypothetical protein  32.43 
 
 
158 aa  47  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.125121 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1219  hypothetical protein  35.82 
 
 
158 aa  44.7  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>